48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2211 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2211  outer membrane efflux protein  100 
 
 
431 aa  852    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.603801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2151  outer membrane efflux protein  55.41 
 
 
419 aa  424  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1748  putative outer membrane protein  26.33 
 
 
395 aa  99.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.617475  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1739  outer membrane efflux protein  26.19 
 
 
400 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.329774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2620  Outer membrane efflux protein  26.58 
 
 
432 aa  79  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18540  outer membrane efflux protein  29.46 
 
 
426 aa  77.8  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134625  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4566  outer membrane efflux protein  23.96 
 
 
449 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2718  hypothetical protein  24.62 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.057627  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2385  outer membrane efflux protein  25.85 
 
 
421 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00190513  normal  0.103604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2098  outer membrane efflux protein  25.85 
 
 
421 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1652  hypothetical protein  28.12 
 
 
431 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166276  normal  0.447974 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0006  Outer membrane protein-like  21.66 
 
 
397 aa  65.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00129905  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0206  outer membrane efflux protein  23.12 
 
 
454 aa  64.3  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00461371  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0141  outer membrane efflux protein  29.34 
 
 
412 aa  64.3  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1145  outer membrane efflux protein  24.1 
 
 
442 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284786  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2671  putative outer membrane protein  27.99 
 
 
423 aa  57.8  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121149  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  24.36 
 
 
437 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.33 
 
 
451 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.3 
 
 
521 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1332  outer membrane efflux protein  29.58 
 
 
441 aa  50.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.592234  normal  0.169457 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  24 
 
 
439 aa  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  24 
 
 
439 aa  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  29.46 
 
 
442 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.49 
 
 
464 aa  47.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.51 
 
 
480 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.64 
 
 
480 aa  46.6  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  26.45 
 
 
440 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1781  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.83 
 
 
517 aa  46.2  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0863506  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  30.14 
 
 
438 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.05 
 
 
463 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  28.5 
 
 
426 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2314  outer membrane efflux protein  25.61 
 
 
653 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.682449  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  23.89 
 
 
432 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2690  type I secretion outer membrane protein, putative  25.61 
 
 
598 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.58 
 
 
494 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 
435 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1598  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.65 
 
 
459 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.538573  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5031  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin CusC  31.65 
 
 
433 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.72 
 
 
455 aa  44.3  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  24.36 
 
 
481 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  23.08 
 
 
434 aa  43.9  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0539  outer membrane efflux family protein, putative  24.04 
 
 
448 aa  43.9  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4536  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.25 
 
 
533 aa  43.9  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748568  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  22.99 
 
 
463 aa  43.9  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  22.76 
 
 
501 aa  43.5  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25 
 
 
478 aa  43.5  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  23.3 
 
 
463 aa  43.5  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  25.16 
 
 
443 aa  43.1  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>