27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1145 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1145  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 442 aa  870    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284786  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4566  outer membrane efflux protein  50 
 
 		 449 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2620  Outer membrane efflux protein  48.21 
 
 		 432 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1652  hypothetical protein  50.52 
 
 		 431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166276  normal  0.447974 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2098  outer membrane efflux protein  48.49 
 
 		 421 aa  307  3e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2385  outer membrane efflux protein  48.49 
 
 		 421 aa  307  3e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00190513  normal  0.103604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18540  outer membrane efflux protein  46.08 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134625  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1332  outer membrane efflux protein  47.16 
 
 		 441 aa  275  9e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.592234  normal  0.169457 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2671  putative outer membrane protein  47.67 
 
 		 423 aa  264  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1748  putative outer membrane protein  33.57 
 
 		 395 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.617475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0141  outer membrane efflux protein  33.26 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0206  outer membrane efflux protein  27.2 
 
 		 454 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00461371  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1739  outer membrane efflux protein  30.28 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329774 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2211  outer membrane efflux protein  24.22 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.603801 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3244  hypothetical protein  28.24 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2151  outer membrane efflux protein  25.43 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0006  Outer membrane protein-like  24.6 
 
 		 397 aa  67  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00129905  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2718  hypothetical protein  23.73 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.057627  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  26.03 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0285  hypothetical protein  23.93 
 
 		 465 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00102  Outer membrane protein  24.87 
 
 		 374 aa  46.6  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3764  hypothetical protein  23.98 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.658461 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0280  hypothetical protein  23.93 
 
 		 465 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0539  outer membrane efflux family protein, putative  28.05 
 
 		 448 aa  45.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  23.56 
 
 		 451 aa  43.9  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  24.76 
 
 		 436 aa  43.5  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  25.79 
 
 		 428 aa  43.5  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>