20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1332 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1332  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 441 aa  832    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.592234  normal  0.169457 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1652  hypothetical protein  71.91 
 
 		 431 aa  485  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166276  normal  0.447974 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4566  outer membrane efflux protein  56.54 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2671  putative outer membrane protein  65.32 
 
 		 423 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2620  Outer membrane efflux protein  57.67 
 
 		 432 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2385  outer membrane efflux protein  57.68 
 
 		 421 aa  382  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00190513  normal  0.103604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2098  outer membrane efflux protein  57.68 
 
 		 421 aa  382  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18540  outer membrane efflux protein  53.73 
 
 		 426 aa  345  8.999999999999999e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134625  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1145  outer membrane efflux protein  47.65 
 
 		 442 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284786  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0141  outer membrane efflux protein  38.39 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1748  putative outer membrane protein  32.31 
 
 		 395 aa  133  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.617475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1739  outer membrane efflux protein  34.37 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329774 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0206  outer membrane efflux protein  31.9 
 
 		 454 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00461371  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2211  outer membrane efflux protein  26.83 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.603801 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0006  Outer membrane protein-like  23.4 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00129905  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3244  hypothetical protein  29.38 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2718  hypothetical protein  23.76 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.057627  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2151  outer membrane efflux protein  23.41 
 
 		 419 aa  53.9  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2096  outer membrane efflux protein  26.15 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.18 
 
 		 428 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>