19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3244 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3244  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  802    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2718  hypothetical protein  33.25 
 
 		 389 aa  193  6e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.057627  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1748  putative outer membrane protein  32.68 
 
 		 395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.617475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0006  Outer membrane protein-like  25 
 
 		 397 aa  114  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00129905  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1739  outer membrane efflux protein  33.02 
 
 		 400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329774 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4566  outer membrane efflux protein  30.2 
 
 		 449 aa  97.8  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0141  outer membrane efflux protein  32.62 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18540  outer membrane efflux protein  32.24 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134625  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1145  outer membrane efflux protein  28.46 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284786  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1652  hypothetical protein  31.09 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166276  normal  0.447974 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2620  Outer membrane efflux protein  27.38 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2098  outer membrane efflux protein  29.82 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2385  outer membrane efflux protein  29.82 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00190513  normal  0.103604 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2671  putative outer membrane protein  31.09 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0206  outer membrane efflux protein  24.86 
 
 		 454 aa  63.5  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00461371  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00102  Outer membrane protein  26.84 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2211  outer membrane efflux protein  27.3 
 
 		 431 aa  53.9  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.603801 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1332  outer membrane efflux protein  29.73 
 
 		 441 aa  49.7  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.592234  normal  0.169457 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3764  hypothetical protein  25.61 
 
 		 410 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.658461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>