25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1679 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1679  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  836    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2803  Outer membrane efflux protein  34.24 
 
 		 414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4374  hypothetical protein  34.58 
 
 		 418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.16313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4506  hypothetical protein  34.58 
 
 		 418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5677  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin NimC  37.15 
 
 		 419 aa  199  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3917  hypothetical protein  35.71 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0283416  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5656  hypothetical protein  34.62 
 
 		 418 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1463  outer membrane efflux protein  30.09 
 
 		 435 aa  126  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00099491  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0144  hypothetical protein  29.02 
 
 		 420 aa  126  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.903633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2707  outer membrane efflux protein  26.92 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3710  outer membrane efflux protein  27.68 
 
 		 411 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  23.85 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.79 
 
 		 493 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02032  outer membrane protein, probably efflux family  23.35 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154608  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  26 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  22.94 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  22.94 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  22.94 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  22.51 
 
 		 416 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  23.92 
 
 		 425 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 464 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  27.52 
 
 		 438 aa  43.5  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  23.92 
 
 		 417 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  22.83 
 
 		 394 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  21.95 
 
 		 426 aa  43.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>