20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1463 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1463  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 435 aa  828    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00099491  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2803  Outer membrane efflux protein  38.89 
 
 		 414 aa  210  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2707  outer membrane efflux protein  37.02 
 
 		 415 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1679  hypothetical protein  30.09 
 
 		 409 aa  151  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0144  hypothetical protein  35.87 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.903633 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5677  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin NimC  32.55 
 
 		 419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4506  hypothetical protein  35.66 
 
 		 418 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321486 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4374  hypothetical protein  35.66 
 
 		 418 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.16313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3917  hypothetical protein  38.04 
 
 		 456 aa  129  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0283416  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5656  hypothetical protein  35.37 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3710  outer membrane efflux protein  35.95 
 
 		 411 aa  113  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  30.63 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2830  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.17 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0538261  hitchhiker  0.00247347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  36.03 
 
 		 444 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  32.7 
 
 		 421 aa  47.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  26.6 
 
 		 454 aa  46.6  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  27.99 
 
 		 433 aa  45.8  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0006  Outer membrane protein-like  28.03 
 
 		 397 aa  45.8  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00129905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18540  outer membrane efflux protein  36.08 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134625  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.91 
 
 		 455 aa  43.9  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>