22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4506 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4506  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  803    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321486 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4374  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  803    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.16313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5677  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin NimC  70.41 
 
 		 419 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5656  hypothetical protein  71.29 
 
 		 418 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3917  hypothetical protein  62.84 
 
 		 456 aa  345  8e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0283416  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1679  hypothetical protein  34.66 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2803  Outer membrane efflux protein  36.94 
 
 		 414 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2707  outer membrane efflux protein  33.42 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1463  outer membrane efflux protein  37.02 
 
 		 435 aa  142  9e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00099491  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0144  hypothetical protein  36.89 
 
 		 420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.903633 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3710  outer membrane efflux protein  33.25 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0006  Outer membrane protein-like  25 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00129905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  24.14 
 
 		 426 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.87 
 
 		 493 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1426  efflux family outer membrane protein  27.27 
 
 		 413 aa  47.4  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1861  efflux family outer membrane protein  20.44 
 
 		 410 aa  47  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  29.67 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  25.96 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4566  outer membrane efflux protein  28.61 
 
 		 449 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2284  outer membrane efflux protein  37.78 
 
 		 420 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  26.35 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1748  putative outer membrane protein  29.39 
 
 		 395 aa  43.5  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.617475  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>