71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0648 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0648  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 328 aa  669    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1302  outer membrane efflux protein  84.31 
 
 		 505 aa  514  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4395  outer membrane efflux protein  45.48 
 
 		 417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0762591  normal  0.909511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4285  outer membrane efflux protein  46.58 
 
 		 456 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1304  outer membrane efflux protein  35.71 
 
 		 493 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0613803 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  25.47 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  25.76 
 
 		 424 aa  72  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  25.38 
 
 		 424 aa  69.7  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  25.11 
 
 		 423 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  23.28 
 
 		 445 aa  65.9  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  24.66 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  26.98 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  25.95 
 
 		 424 aa  62.8  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.03 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  25.67 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  23.59 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  24.75 
 
 		 465 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  25.24 
 
 		 424 aa  59.7  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  26.15 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  23.14 
 
 		 426 aa  57  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  23.38 
 
 		 426 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  25.69 
 
 		 435 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  26.51 
 
 		 440 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  24.91 
 
 		 501 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  25.48 
 
 		 461 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  25.48 
 
 		 461 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  25.48 
 
 		 461 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  20.7 
 
 		 416 aa  53.5  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  25.48 
 
 		 461 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  24.23 
 
 		 443 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  25.48 
 
 		 452 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  25.48 
 
 		 443 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  25.48 
 
 		 443 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  21.34 
 
 		 446 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  24.15 
 
 		 428 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  27.22 
 
 		 443 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0667  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 478 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  23.27 
 
 		 458 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  26.45 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4262  outer membrane efflux protein  24.27 
 
 		 477 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.495542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.99 
 
 		 437 aa  50.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  20.83 
 
 		 472 aa  50.1  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  22.97 
 
 		 424 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.48 
 
 		 489 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  22.73 
 
 		 443 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0413  outer membrane efflux protein  25.76 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  22.64 
 
 		 443 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.44 
 
 		 453 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.73 
 
 		 455 aa  47.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  24.77 
 
 		 473 aa  47  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  24.38 
 
 		 463 aa  47  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  24.51 
 
 		 485 aa  47  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5135  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.18 
 
 		 493 aa  46.2  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3978  outer membrane efflux protein  21.68 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05506  putative outer-membrane drug efflux protein  24.32 
 
 		 508 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0292  Outer membrane efflux protein  27.03 
 
 		 432 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765252  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  20.07 
 
 		 423 aa  44.3  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4862  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.28 
 
 		 517 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0750555 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0563  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  24.83 
 
 		 482 aa  43.9  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0291463  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4223  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.94 
 
 		 510 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00337155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4333  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.94 
 
 		 510 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379784  normal  0.0805194 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  23.59 
 
 		 415 aa  43.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2564  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.55 
 
 		 495 aa  43.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248386  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  24.39 
 
 		 467 aa  43.1  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4106  outer membrane efflux protein  24.68 
 
 		 473 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  24.32 
 
 		 489 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  23.93 
 
 		 442 aa  42.7  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  20 
 
 		 462 aa  42.4  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1990  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.49 
 
 		 513 aa  42.4  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>