264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0292 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0292  Outer membrane efflux protein  100 
 
 
432 aa  857    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765252  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4096  outer membrane efflux protein  36.73 
 
 
414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.592471  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  29.73 
 
 
428 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  28.88 
 
 
428 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  30.46 
 
 
423 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  30.46 
 
 
423 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  30.46 
 
 
423 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  30.95 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.87 
 
 
467 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41681  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  27.54 
 
 
415 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  26.28 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2819  outer membrane protein OprJ  29.31 
 
 
468 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.980235 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  28.33 
 
 
418 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  22.2 
 
 
472 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1545  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30 
 
 
485 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6200  multidrug efflux system outer membrane subunit  24.04 
 
 
504 aa  66.6  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.584656  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2756  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.61 
 
 
469 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0415066  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  27.52 
 
 
438 aa  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  27.65 
 
 
418 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  28.26 
 
 
408 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1522  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.24 
 
 
485 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4536  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.17 
 
 
533 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748568  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  25.54 
 
 
423 aa  64.7  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 
423 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4920  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.45 
 
 
513 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31782  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5350  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.57 
 
 
513 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00199019  normal  0.49097 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1600  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.78 
 
 
483 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.375157 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1614  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.79 
 
 
487 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0245631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  24.5 
 
 
438 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3016  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.57 
 
 
513 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0851  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.17 
 
 
537 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238751  hitchhiker  0.00377502 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1768  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  27.22 
 
 
434 aa  61.6  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  24.47 
 
 
479 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.61 
 
 
511 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  23.94 
 
 
489 aa  60.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  26.4 
 
 
471 aa  60.5  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  29.36 
 
 
442 aa  60.5  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1624  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.19 
 
 
486 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1144  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.19 
 
 
486 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.804634  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.59 
 
 
485 aa  60.1  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4769  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.02 
 
 
485 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  28.19 
 
 
408 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  27.63 
 
 
416 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1111  Outer membrane efflux protein  27.79 
 
 
492 aa  59.7  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.33067  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5601  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.18 
 
 
475 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5965  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.18 
 
 
475 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  26.48 
 
 
451 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3375  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.3 
 
 
517 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0151483  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6990  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.64 
 
 
479 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0598431  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1941  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.98 
 
 
497 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211357  normal  0.0401761 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.6 
 
 
475 aa  57.4  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0722212  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  25.46 
 
 
423 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3870  Co/Zn/Cd efflux system component  25.6 
 
 
448 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0387  Fis family transcriptional regulator  26.06 
 
 
492 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  22.65 
 
 
421 aa  57.4  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0259  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  24.5 
 
 
461 aa  57.4  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4297  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  24.5 
 
 
461 aa  57  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00173675  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  24.27 
 
 
460 aa  57  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.583273  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  25.45 
 
 
443 aa  56.6  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  23.64 
 
 
422 aa  56.6  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1872  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.18 
 
 
509 aa  56.6  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  26.29 
 
 
453 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1855  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.7 
 
 
464 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.859631  normal  0.291675 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4966  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.27 
 
 
466 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.953441  normal  0.0124942 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2104  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.5 
 
 
510 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.409236  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  25.75 
 
 
433 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2096  outer membrane efflux protein  27.47 
 
 
419 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0653  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  24.41 
 
 
460 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.191725  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4072  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.24 
 
 
464 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3371  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.68 
 
 
484 aa  55.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00556392  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2179  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.21 
 
 
462 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.159854  normal  0.0708517 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.02 
 
 
495 aa  54.7  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1994  outer membrane efflux protein  24.71 
 
 
495 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184092  normal  0.0261874 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  24.41 
 
 
460 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284493  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4021  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.89 
 
 
483 aa  54.7  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227062  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3501  Outer membrane efflux protein  24.01 
 
 
489 aa  55.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4697  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.81 
 
 
513 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204697  normal  0.315368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  22.76 
 
 
424 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  26.26 
 
 
441 aa  54.3  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2035  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.99 
 
 
486 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152355  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 
417 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1785  outer membrane efflux protein  27.92 
 
 
404 aa  54.3  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0326446  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  22.57 
 
 
423 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27410  putative outer membrane protein precursor  21.62 
 
 
479 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.721932  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1620  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.39 
 
 
495 aa  53.9  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.596211 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2072  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.12 
 
 
495 aa  53.5  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0610186  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3271  outer membrane efflux protein OprA  26.1 
 
 
467 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  23.99 
 
 
431 aa  53.5  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2339  outer membrane efflux protein  25.3 
 
 
437 aa  53.5  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.884796  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2315  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.75 
 
 
461 aa  53.5  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.44899 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5856  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.69 
 
 
493 aa  53.5  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1591  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.16 
 
 
481 aa  53.1  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000292967 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0943  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.09 
 
 
484 aa  52.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0506  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.14 
 
 
492 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.21 
 
 
521 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  22.66 
 
 
423 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3378  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.14 
 
 
470 aa  53.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.469197 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2529  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.53 
 
 
485 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.918806  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7027  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.19 
 
 
478 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  0.585091 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1840  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.07 
 
 
462 aa  52.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.37883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>