148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1785 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1785  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 404 aa  766    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0326446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0292  Outer membrane efflux protein  26.5 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765252  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0943  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.51 
 
 		 484 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  24.77 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5135  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.99 
 
 		 493 aa  66.6  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4096  outer membrane efflux protein  30.51 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.592471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  29.08 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  25.38 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.32 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1364  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.08 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424146 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.42 
 
 		 471 aa  63.2  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  24.13 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  29.21 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2564  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.19 
 
 		 495 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248386  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  21.5 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4333  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.76 
 
 		 510 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379784  normal  0.0805194 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4223  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.76 
 
 		 510 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00337155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  25.91 
 
 		 432 aa  59.7  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  25.32 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.18 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05506  putative outer-membrane drug efflux protein  29 
 
 		 508 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2373  HelC protein  27.03 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3375  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.15 
 
 		 517 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0151483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3184  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.55 
 
 		 475 aa  54.3  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1063  hypothetical protein  27.31 
 
 		 453 aa  54.3  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0533  outer membrane efflux protein  27.31 
 
 		 453 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0594  outer membrane efflux protein  27.31 
 
 		 508 aa  53.9  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  25.54 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 419 aa  53.9  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1176  Outer membrane efflux protein  28.52 
 
 		 429 aa  53.1  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5228  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.82 
 
 		 513 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  25.21 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4697  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.82 
 
 		 513 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204697  normal  0.315368 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4920  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.82 
 
 		 513 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3983  outer membrane efflux protein  21.93 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2178  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.48 
 
 		 479 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2733  outer membrane efflux protein  19.13 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0378376  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2869  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.28 
 
 		 480 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451085  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  25.67 
 
 		 438 aa  51.2  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.99 
 
 		 495 aa  51.6  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3016  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.82 
 
 		 513 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5350  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.82 
 
 		 513 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00199019  normal  0.49097 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1300  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.57 
 
 		 468 aa  51.2  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.634439  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  24.85 
 
 		 416 aa  50.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.82 
 
 		 511 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4072  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.62 
 
 		 464 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4262  outer membrane efflux protein  28.67 
 
 		 477 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.495542 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.91 
 
 		 521 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  25.91 
 
 		 420 aa  50.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4888  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.8 
 
 		 482 aa  50.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595836  normal  0.509529 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2104  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.6 
 
 		 510 aa  50.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.409236  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  24.81 
 
 		 465 aa  49.7  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1794  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.22 
 
 		 486 aa  49.3  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0851  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.83 
 
 		 537 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238751  hitchhiker  0.00377502 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.36 
 
 		 496 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.36 
 
 		 496 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4333  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.39 
 
 		 499 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00474819  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2713  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.64 
 
 		 477 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2682  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.58 
 
 		 451 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.829421  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.14 
 
 		 482 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1840  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.59 
 
 		 462 aa  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.37883  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1793  outer membrane efflux protein  27.53 
 
 		 463 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.314198  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2443  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.72 
 
 		 544 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.42 
 
 		 516 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2339  outer membrane efflux protein  26 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.884796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3371  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.98 
 
 		 484 aa  47.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00556392  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  27.97 
 
 		 458 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0814  outer membrane efflux protein  26.61 
 
 		 455 aa  47.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.881482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3507  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.18 
 
 		 490 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0827  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.58 
 
 		 483 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00460212  hitchhiker  0.00000000259986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1854  putative outer membrane multidrug resistance lipoprotein  26.88 
 
 		 475 aa  47  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0993  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.8 
 
 		 475 aa  47  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1415  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  28.02 
 
 		 520 aa  46.6  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0309  outer membrane efflux protein  29.73 
 
 		 458 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0867  hypothetical protein  29.59 
 
 		 489 aa  46.6  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0390174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1124  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.19 
 
 		 509 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.405736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2657  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.72 
 
 		 473 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0121184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4865  RND cation/multidrug efflux system outer membrane protein, NodT  29.04 
 
 		 493 aa  46.6  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000716421  normal  0.820676 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3547  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.94 
 
 		 477 aa  46.6  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.138729  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4646  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.41 
 
 		 464 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1582  outer membrane efflux protein  28.41 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0904474  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1464  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.96 
 
 		 510 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1877  Outer membrane efflux protein  26.79 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2059  Outer membrane efflux protein  29.05 
 
 		 513 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26387  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  24.53 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1996  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.73 
 
 		 500 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  26.77 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4021  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.12 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0925  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  25.8 
 
 		 460 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1905  outer membrane efflux protein OprA  29.05 
 
 		 516 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0834  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  25.8 
 
 		 460 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1842  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.96 
 
 		 510 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2184  outer membrane efflux protein  26.43 
 
 		 460 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4056  outer membrane efflux protein  27.23 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  27.19 
 
 		 470 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2447  outer membrane efflux protein  34.45 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0515  outer membrane efflux protein OprC  25.96 
 
 		 510 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0418  outer membrane efflux protein OprC  25.96 
 
 		 510 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0829  outer membrane efflux protein OprC  25.96 
 
 		 510 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.85 
 
 		 494 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>