More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3427 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  100 
 
 
470 aa  927    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1300  RND efflux system outer membrane lipoprotein  81.43 
 
 
468 aa  670    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.634439  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0867  hypothetical protein  70.66 
 
 
489 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0390174  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2564  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  65.97 
 
 
495 aa  539  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5135  RND efflux system outer membrane lipoprotein  64.61 
 
 
493 aa  539  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1364  RND efflux system outer membrane lipoprotein  63.11 
 
 
500 aa  514  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0424146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0943  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  65.24 
 
 
484 aa  499  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.33 
 
 
516 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.07 
 
 
521 aa  342  7e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4333  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  46.27 
 
 
510 aa  336  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379784  normal  0.0805194 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4223  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  46.27 
 
 
510 aa  336  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00337155  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4697  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.25 
 
 
513 aa  335  9e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204697  normal  0.315368 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4920  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.15 
 
 
513 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31782  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1794  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  45.48 
 
 
486 aa  334  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3827  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  45.65 
 
 
504 aa  333  4e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0692116  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3375  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.01 
 
 
517 aa  332  8e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0151483  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5350  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.73 
 
 
513 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00199019  normal  0.49097 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3016  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  45.73 
 
 
513 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1464  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.56 
 
 
510 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2104  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.93 
 
 
510 aa  329  7e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.409236  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2146  outer membrane efflux protein OprC  43.33 
 
 
510 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4536  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.15 
 
 
533 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748568  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0829  outer membrane efflux protein OprC  43.33 
 
 
510 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0515  outer membrane efflux protein OprC  43.33 
 
 
510 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0418  outer membrane efflux protein OprC  43.33 
 
 
510 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1842  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.33 
 
 
510 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.12 
 
 
511 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0851  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.15 
 
 
537 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238751  hitchhiker  0.00377502 
 
 
-
 
NC_003296  RS05506  putative outer-membrane drug efflux protein  45.8 
 
 
508 aa  323  6e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5228  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.49 
 
 
513 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5123  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.46 
 
 
510 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4333  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.24 
 
 
499 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00474819  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4865  RND cation/multidrug efflux system outer membrane protein, NodT  41.94 
 
 
493 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000716421  normal  0.820676 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3811  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.69 
 
 
476 aa  284  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.521708  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28780  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.79 
 
 
512 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506262  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0511  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  36.3 
 
 
497 aa  273  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310056  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4652  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.56 
 
 
464 aa  272  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0569  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.25 
 
 
486 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20716  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7210  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.5 
 
 
486 aa  265  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.91 
 
 
487 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.59 
 
 
477 aa  264  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.321053 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1391  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.31 
 
 
485 aa  260  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228401  normal  0.164456 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2428  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.68 
 
 
509 aa  260  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.440095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.26 
 
 
495 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.71 
 
 
495 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4619  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.09 
 
 
488 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.573778  normal  0.397239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3749  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.09 
 
 
488 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202049  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5685  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.45 
 
 
488 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.166803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  34.48 
 
 
498 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4181  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.24 
 
 
501 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366543  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4293  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.24 
 
 
501 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6520  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.83 
 
 
500 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.128206 
 
 
-
 
NC_003296  RS03144  putative outer membrane CHANEL lipoprotein transmembrane  37.05 
 
 
508 aa  250  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.330645 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2756  outer membrane efflux protein  32.86 
 
 
490 aa  249  6e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1968  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.16 
 
 
471 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000949064  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.57 
 
 
489 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670028  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2098  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.72 
 
 
471 aa  247  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0040  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.22 
 
 
520 aa  246  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1748  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  35.74 
 
 
488 aa  245  9e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630432  normal  0.156732 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  33.19 
 
 
499 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02156  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  36.58 
 
 
483 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.910807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.8 
 
 
495 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3948  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.95 
 
 
523 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.822582 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0069  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.23 
 
 
523 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6326  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.53 
 
 
514 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.167129  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5742  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.53 
 
 
497 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238393  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2832  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.92 
 
 
520 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1503  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.53 
 
 
514 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0171  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.27 
 
 
490 aa  241  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0049  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.01 
 
 
509 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963186  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0050  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.23 
 
 
523 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151271  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2070  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.78 
 
 
498 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0633642  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6990  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.44 
 
 
501 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.452647 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0020  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.23 
 
 
523 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.25615  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0019  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.64 
 
 
539 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308598  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3232  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.06 
 
 
523 aa  239  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.254242  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0347  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.95 
 
 
478 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2189  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.4 
 
 
496 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.250734  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2332  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.91 
 
 
496 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3821  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.02 
 
 
484 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.467284  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0051  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.14 
 
 
527 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27692  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4898  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.02 
 
 
484 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4316  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.26 
 
 
511 aa  237  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.138583 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4489  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.23 
 
 
523 aa  237  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000880078  hitchhiker  0.0020567 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2829  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.55 
 
 
478 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3582  RND efflux transporter  32.98 
 
 
496 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109729  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0232  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.65 
 
 
538 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0020  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  35.65 
 
 
538 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374207  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0020  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  35.65 
 
 
538 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1878  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.43 
 
 
538 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2773  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.43 
 
 
538 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3506  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.43 
 
 
538 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2674  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.43 
 
 
538 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.831333  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0358  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.44 
 
 
509 aa  233  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5986  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.75 
 
 
497 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4364  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.29 
 
 
509 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.847898  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.16 
 
 
478 aa  232  9e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.4 
 
 
477 aa  232  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000572805  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4154  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.36 
 
 
496 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.594754  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1142  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.24 
 
 
492 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258577  normal  0.581397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>