247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6148 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6148  proton antiporter cation efflux protein NccC  100 
 
 		 448 aa  881    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6208  outer membrane efflux protein  78.23 
 
 		 418 aa  527  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0682247 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5148  outer membrane efflux protein  67.26 
 
 		 435 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5135  outer membrane efflux protein  53.85 
 
 		 435 aa  339  5e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2284  outer membrane efflux protein  45.54 
 
 		 420 aa  264  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2803  outer membrane efflux protein  40.05 
 
 		 412 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.887689  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3956  outer membrane efflux protein  39.18 
 
 		 417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2577  outer membrane efflux protein  33.43 
 
 		 435 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  30.66 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  25.93 
 
 		 415 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2148  outer membrane efflux protein  32.93 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  29.63 
 
 		 418 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  29.34 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  30.98 
 
 		 443 aa  97.8  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  27.82 
 
 		 423 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 		 416 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  28.1 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  27.82 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  28.97 
 
 		 428 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  29.14 
 
 		 431 aa  90.1  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2321  outer membrane efflux protein  31.41 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.760032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  26.83 
 
 		 421 aa  87.8  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  29.64 
 
 		 426 aa  87.4  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  26.55 
 
 		 424 aa  86.7  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  27.9 
 
 		 424 aa  86.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  29.76 
 
 		 437 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2294  outer membrane efflux protein  33.51 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  29.3 
 
 		 435 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  26.11 
 
 		 451 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  28.76 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  29.3 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  29.3 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  27.65 
 
 		 425 aa  83.6  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  27.81 
 
 		 465 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  31.15 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  29.23 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  29.23 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  27.67 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  29.23 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  29.23 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  29.23 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  26.92 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  29.23 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.55 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  25.55 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  25.55 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  28.96 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  28.1 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  27.14 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  25.76 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  27.49 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  27.7 
 
 		 451 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  23.37 
 
 		 471 aa  76.6  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  27 
 
 		 422 aa  76.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  26.24 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2339  outer membrane efflux protein  29.6 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.884796  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  27.79 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  24.79 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1958  aconitate hydratase 1  26.35 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0713794  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2567  outer membrane efflux protein  29.54 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  32.81 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  26.39 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  28.69 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  32.49 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2695  outer membrane efflux protein  27.01 
 
 		 512 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  31.41 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  23.28 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  28.49 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  26.34 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  26.48 
 
 		 431 aa  67  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  26.36 
 
 		 460 aa  66.6  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.58 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  24.38 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  28.08 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  23.08 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.6 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.25 
 
 		 474 aa  63.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  25.87 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  25.34 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  30.38 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  26.71 
 
 		 470 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  27.27 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  26.03 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2158  outer membrane efflux protein  28.72 
 
 		 467 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00293127  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2609  outer membrane efflux protein  29.15 
 
 		 425 aa  59.7  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1294  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  22.67 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3497  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.24 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3841  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.18 
 
 		 490 aa  57  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626052  normal  0.467321 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.89 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0811  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.13 
 
 		 517 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0761  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.09 
 
 		 491 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1124  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.41 
 
 		 509 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.405736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2447  outer membrane efflux protein  30.03 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  25.23 
 
 		 432 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0292  Outer membrane efflux protein  26.67 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765252  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1759  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.71 
 
 		 600 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000901075  normal  0.0327712 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1387  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.34 
 
 		 498 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  26.46 
 
 		 420 aa  55.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2435  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.94 
 
 		 500 aa  54.7  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164231 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2564  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.37 
 
 		 495 aa  55.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>