23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03275 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03275  putative cation efflux protein  100 
 
 		 117 aa  244  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2394  outer membrane efflux protein  43.33 
 
 		 487 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00318  putative cation efflux protein  40.66 
 
 		 454 aa  79.7  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4856  putative cation efflux protein  43.75 
 
 		 496 aa  78.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1929  outer membrane efflux protein  33.67 
 
 		 447 aa  63.5  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.845235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1368  copper/silver resistance outer membrane protein  34.04 
 
 		 437 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0134  outer membrane efflux protein  30.34 
 
 		 439 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  36.59 
 
 		 449 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06364  hypothetical protein  30.21 
 
 		 463 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001397  heavy metal RND efflux CzcC family  37.5 
 
 		 473 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0176  outer membrane protein  26.37 
 
 		 414 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0020  outer membrane efflux protein  29 
 
 		 417 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0022  outer membrane efflux protein  29 
 
 		 417 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0020  outer membrane efflux protein  29 
 
 		 417 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2548  outer membrane efflux protein  25.27 
 
 		 408 aa  45.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0716  hypothetical protein  28.71 
 
 		 444 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2394  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  28.92 
 
 		 418 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.794005  hitchhiker  0.00223071 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1335  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  25.58 
 
 		 429 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1388  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 		 417 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3041  outer membrane efflux protein  26.73 
 
 		 417 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1625  putative outer membrane cation efflux protein  27.55 
 
 		 438 aa  41.2  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.164606 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  31.94 
 
 		 424 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  29.67 
 
 		 426 aa  41.2  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>