91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2765 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010070  Bmul_6292  outer membrane efflux protein  77.91 
 
 
498 aa  771    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.260908 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0713  outer membrane efflux protein  79.25 
 
 
554 aa  686    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  70.64 
 
 
486 aa  679    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0621  outer membrane efflux protein  79.03 
 
 
554 aa  683    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4754  outer membrane efflux protein  92.2 
 
 
500 aa  892    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203593  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5189  outer membrane efflux protein  84.25 
 
 
523 aa  811    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2295  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  73.83 
 
 
476 aa  676    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.176348 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3413  outer membrane efflux protein  92.2 
 
 
500 aa  892    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1960  copper tolerance protein  77.41 
 
 
536 aa  658    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2041  outer membrane efflux protein  72.67 
 
 
501 aa  697    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2765  outer membrane efflux protein  100 
 
 
498 aa  1008    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4103  outer membrane efflux protein  91.8 
 
 
500 aa  864    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733493  normal  0.726802 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2008  copper tolerance protein  79.25 
 
 
554 aa  684    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3352  outer membrane efflux protein  86.24 
 
 
512 aa  818    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4025  outer membrane efflux protein  62.53 
 
 
470 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000146806  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3911  outer membrane efflux protein  62.53 
 
 
470 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120008  normal  0.391344 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0496  putative copper resistance-related lipoprotein  51.65 
 
 
477 aa  474  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.620872 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1633  putative copper resistance-related lipoprotein  53.23 
 
 
479 aa  457  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.158935 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1265  outer membrane efflux protein  50.44 
 
 
481 aa  452  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2657  outer membrane efflux protein  52.09 
 
 
466 aa  438  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763881  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1079  outer membrane efflux protein  50.11 
 
 
465 aa  395  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0935  outer membrane efflux protein  50.11 
 
 
465 aa  395  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.365344  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6518  putative Outer membrane efflux protein  40.69 
 
 
475 aa  348  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753245  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4904  outer membrane efflux protein  41.89 
 
 
488 aa  346  6e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.878997  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4267  copper tolerance protein  40.18 
 
 
488 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1090  outer membrane efflux protein  39.91 
 
 
483 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4384  outer membrane efflux protein  38.9 
 
 
485 aa  333  5e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4601  outer membrane efflux protein  42.3 
 
 
475 aa  331  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.332073  normal  0.615443 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4826  outer membrane efflux protein  42.3 
 
 
475 aa  329  6e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836634  normal  0.338795 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4633  outer membrane efflux protein  38.67 
 
 
485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706868  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0118  putative copper resistance protein  40.47 
 
 
543 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3484  putative copper resistance-related lipoprotein  41.51 
 
 
472 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2578  outer membrane efflux protein  39.55 
 
 
535 aa  317  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0560227  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1030  outer membrane efflux protein  39.33 
 
 
535 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2199  putative copper resistance-related lipoprotein  41.74 
 
 
476 aa  312  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2670  putative copper resistance-related lipoprotein  42.19 
 
 
476 aa  311  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0933723  normal  0.360858 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0314  outer membrane efflux protein  40 
 
 
486 aa  309  6.999999999999999e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.116177  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2911  copper tolerance protein  42.89 
 
 
482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2723  putative copper resistance-related lipoprotein  40.95 
 
 
476 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5687  putative copper resistance-related lipoprotein  41.04 
 
 
475 aa  303  7.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3982  putative metal ion efflux outer membrane protein  41.15 
 
 
470 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9851  copper tolerance protein  39.66 
 
 
486 aa  300  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7875  outer membrane efflux protein  39.6 
 
 
483 aa  295  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639992  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4553  putative copper resistance-related lipoprotein  39.6 
 
 
472 aa  291  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.910933 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5028  hypothetical protein  41.12 
 
 
487 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.924524 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5861  conserved hypothetical conserved membrane protein  39.65 
 
 
488 aa  282  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0736  putative copper resistance-related lipoprotein  38.44 
 
 
475 aa  243  7e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1209  copper tolerance protein  39.35 
 
 
477 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0296816  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2599  copper tolerance protein  39.35 
 
 
477 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0277245  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1262  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  33.4 
 
 
399 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  29.5 
 
 
547 aa  144  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0495  outer membrane efflux protein  29.24 
 
 
493 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2283  outer membrane efflux protein  29.75 
 
 
453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1205  Outer membrane protein-like protein  32.91 
 
 
438 aa  113  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  23.79 
 
 
437 aa  64.3  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  23.16 
 
 
415 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23 
 
 
437 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0017  outer membrane efflux protein  24.31 
 
 
473 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  22.28 
 
 
428 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  19.79 
 
 
523 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  24.63 
 
 
435 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  22.48 
 
 
437 aa  52.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  21.78 
 
 
432 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.1 
 
 
488 aa  51.6  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2191  outer membrane efflux protein  22.07 
 
 
492 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  23.59 
 
 
440 aa  51.2  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  23.28 
 
 
431 aa  50.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 
413 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  22.16 
 
 
426 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0309  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.67 
 
 
531 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  21.13 
 
 
421 aa  49.3  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.71 
 
 
482 aa  49.3  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  22.47 
 
 
443 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0309  outer membrane efflux protein  27.24 
 
 
458 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  23.53 
 
 
441 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  25.29 
 
 
432 aa  48.5  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  24.56 
 
 
437 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  23.98 
 
 
435 aa  47.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  23.65 
 
 
432 aa  47.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  23.41 
 
 
438 aa  47  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.47 
 
 
434 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1551  outer membrane efflux protein  25.65 
 
 
443 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  24.08 
 
 
458 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  18.95 
 
 
409 aa  45.8  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  24.85 
 
 
439 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  24.85 
 
 
439 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1541  Outer membrane efflux protein  26.28 
 
 
486 aa  45.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  23.29 
 
 
437 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  21.2 
 
 
472 aa  43.9  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0288  outer membrane efflux protein  26.7 
 
 
464 aa  43.9  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.708573  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  27.19 
 
 
444 aa  43.5  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>