57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3484 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4553  putative copper resistance-related lipoprotein  83.04 
 
 		 472 aa  736    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.910933 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5687  putative copper resistance-related lipoprotein  75.06 
 
 		 475 aa  648    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3484  putative copper resistance-related lipoprotein  100 
 
 		 472 aa  948    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2199  putative copper resistance-related lipoprotein  59.35 
 
 		 476 aa  557  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2723  putative copper resistance-related lipoprotein  58.84 
 
 		 476 aa  546  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2670  putative copper resistance-related lipoprotein  58.58 
 
 		 476 aa  535  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0933723  normal  0.360858 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0736  putative copper resistance-related lipoprotein  55.09 
 
 		 475 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3982  putative metal ion efflux outer membrane protein  45.16 
 
 		 470 aa  361  1e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  43.33 
 
 		 486 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1633  putative copper resistance-related lipoprotein  44.37 
 
 		 479 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158935 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0496  putative copper resistance-related lipoprotein  44.07 
 
 		 477 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.620872 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6292  outer membrane efflux protein  42.54 
 
 		 498 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260908 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2295  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  43.65 
 
 		 476 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.176348 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2041  outer membrane efflux protein  42.42 
 
 		 501 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4025  outer membrane efflux protein  43.75 
 
 		 470 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000146806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3911  outer membrane efflux protein  43.75 
 
 		 470 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120008  normal  0.391344 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0713  outer membrane efflux protein  45.34 
 
 		 554 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1265  outer membrane efflux protein  41.95 
 
 		 481 aa  305  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0621  outer membrane efflux protein  45.34 
 
 		 554 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2765  outer membrane efflux protein  43.29 
 
 		 498 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3413  outer membrane efflux protein  42.44 
 
 		 500 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4754  outer membrane efflux protein  42.44 
 
 		 500 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2008  copper tolerance protein  45.1 
 
 		 554 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4103  outer membrane efflux protein  44.7 
 
 		 500 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733493  normal  0.726802 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2657  outer membrane efflux protein  43.66 
 
 		 466 aa  293  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1960  copper tolerance protein  44.83 
 
 		 536 aa  291  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3352  outer membrane efflux protein  43.17 
 
 		 512 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5189  outer membrane efflux protein  42.39 
 
 		 523 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1079  outer membrane efflux protein  41.33 
 
 		 465 aa  268  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0935  outer membrane efflux protein  41.33 
 
 		 465 aa  268  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.365344  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6518  putative Outer membrane efflux protein  35.6 
 
 		 475 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2911  copper tolerance protein  37.07 
 
 		 482 aa  240  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4384  outer membrane efflux protein  34.31 
 
 		 485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4601  outer membrane efflux protein  35.45 
 
 		 475 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.332073  normal  0.615443 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4826  outer membrane efflux protein  34.79 
 
 		 475 aa  224  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836634  normal  0.338795 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4633  outer membrane efflux protein  33.12 
 
 		 485 aa  224  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706868  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0118  putative copper resistance protein  34.49 
 
 		 543 aa  223  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4904  outer membrane efflux protein  33.71 
 
 		 488 aa  219  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.878997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1209  copper tolerance protein  36.95 
 
 		 477 aa  216  9e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0296816  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2599  copper tolerance protein  36.81 
 
 		 477 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0277245  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1090  outer membrane efflux protein  33.33 
 
 		 483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9851  copper tolerance protein  31.35 
 
 		 486 aa  210  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2578  outer membrane efflux protein  31.64 
 
 		 535 aa  208  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0560227  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1030  outer membrane efflux protein  33.33 
 
 		 535 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4267  copper tolerance protein  31.97 
 
 		 488 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0314  outer membrane efflux protein  31.79 
 
 		 486 aa  203  6e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.116177  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5861  conserved hypothetical conserved membrane protein  32.59 
 
 		 488 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5028  hypothetical protein  34.55 
 
 		 487 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.924524 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7875  outer membrane efflux protein  32.14 
 
 		 483 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639992  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1262  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  35.19 
 
 		 399 aa  169  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1205  Outer membrane protein-like protein  31.16 
 
 		 438 aa  118  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  26.7 
 
 		 547 aa  94.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2283  outer membrane efflux protein  30.95 
 
 		 453 aa  91.7  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0495  outer membrane efflux protein  25.11 
 
 		 493 aa  74.3  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  24.66 
 
 		 435 aa  46.6  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.8 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.57 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>