55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1205 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1205  Outer membrane protein-like protein  100 
 
 		 438 aa  851    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1633  putative copper resistance-related lipoprotein  35.93 
 
 		 479 aa  155  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158935 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1262  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  36.18 
 
 		 399 aa  153  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2657  outer membrane efflux protein  36.12 
 
 		 466 aa  150  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  35.42 
 
 		 486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0496  putative copper resistance-related lipoprotein  36.28 
 
 		 477 aa  143  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.620872 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6292  outer membrane efflux protein  33.11 
 
 		 498 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260908 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1265  outer membrane efflux protein  34.03 
 
 		 481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5687  putative copper resistance-related lipoprotein  38.41 
 
 		 475 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2295  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  34.1 
 
 		 476 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.176348 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2199  putative copper resistance-related lipoprotein  35.03 
 
 		 476 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2723  putative copper resistance-related lipoprotein  36.88 
 
 		 476 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4025  outer membrane efflux protein  34.65 
 
 		 470 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000146806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3911  outer membrane efflux protein  34.65 
 
 		 470 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120008  normal  0.391344 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4553  putative copper resistance-related lipoprotein  34.85 
 
 		 472 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.910933 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2670  putative copper resistance-related lipoprotein  35.97 
 
 		 476 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0933723  normal  0.360858 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3982  putative metal ion efflux outer membrane protein  35.45 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3484  putative copper resistance-related lipoprotein  36.09 
 
 		 472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6518  putative Outer membrane efflux protein  33.93 
 
 		 475 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0713  outer membrane efflux protein  35.74 
 
 		 554 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5861  conserved hypothetical conserved membrane protein  33.43 
 
 		 488 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2008  copper tolerance protein  35.77 
 
 		 554 aa  123  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2041  outer membrane efflux protein  30.21 
 
 		 501 aa  122  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9851  copper tolerance protein  33.67 
 
 		 486 aa  122  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0621  outer membrane efflux protein  35.4 
 
 		 554 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2765  outer membrane efflux protein  32.91 
 
 		 498 aa  120  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0736  putative copper resistance-related lipoprotein  37.38 
 
 		 475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5028  hypothetical protein  33.67 
 
 		 487 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.924524 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1960  copper tolerance protein  37.23 
 
 		 536 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4601  outer membrane efflux protein  32.77 
 
 		 475 aa  113  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.332073  normal  0.615443 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4826  outer membrane efflux protein  32.77 
 
 		 475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836634  normal  0.338795 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4103  outer membrane efflux protein  33.66 
 
 		 500 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733493  normal  0.726802 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4754  outer membrane efflux protein  33.66 
 
 		 500 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203593  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3413  outer membrane efflux protein  33.66 
 
 		 500 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4267  copper tolerance protein  31.06 
 
 		 488 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2578  outer membrane efflux protein  30.55 
 
 		 535 aa  106  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0560227  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2911  copper tolerance protein  33.77 
 
 		 482 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1030  outer membrane efflux protein  28.48 
 
 		 535 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0314  outer membrane efflux protein  30.28 
 
 		 486 aa  104  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.116177  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0118  putative copper resistance protein  29.93 
 
 		 543 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1090  outer membrane efflux protein  29.63 
 
 		 483 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4904  outer membrane efflux protein  30.56 
 
 		 488 aa  99.8  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.878997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4384  outer membrane efflux protein  29.55 
 
 		 485 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7875  outer membrane efflux protein  31.83 
 
 		 483 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639992  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4633  outer membrane efflux protein  28.44 
 
 		 485 aa  94.4  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706868  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5189  outer membrane efflux protein  31.33 
 
 		 523 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2599  copper tolerance protein  35.53 
 
 		 477 aa  89.7  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0277245  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1209  copper tolerance protein  35.53 
 
 		 477 aa  89.7  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0296816  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3352  outer membrane efflux protein  31.33 
 
 		 512 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1079  outer membrane efflux protein  33.44 
 
 		 465 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0935  outer membrane efflux protein  33.44 
 
 		 465 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.365344  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  28.16 
 
 		 547 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2283  outer membrane efflux protein  27.33 
 
 		 453 aa  52.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2912  hypothetical protein  41.18 
 
 		 130 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal  0.0210162 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1263  hypothetical protein  40.62 
 
 		 109 aa  43.9  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>