57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0736 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0736  putative copper resistance-related lipoprotein  100 
 
 		 475 aa  947    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2670  putative copper resistance-related lipoprotein  57.52 
 
 		 476 aa  508  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0933723  normal  0.360858 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2199  putative copper resistance-related lipoprotein  55.56 
 
 		 476 aa  504  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2723  putative copper resistance-related lipoprotein  54.73 
 
 		 476 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3484  putative copper resistance-related lipoprotein  55.96 
 
 		 472 aa  478  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5687  putative copper resistance-related lipoprotein  56.81 
 
 		 475 aa  474  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4553  putative copper resistance-related lipoprotein  55.86 
 
 		 472 aa  462  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.910933 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0496  putative copper resistance-related lipoprotein  42.76 
 
 		 477 aa  300  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.620872 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1633  putative copper resistance-related lipoprotein  42.47 
 
 		 479 aa  296  4e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158935 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  38.33 
 
 		 486 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3982  putative metal ion efflux outer membrane protein  42.66 
 
 		 470 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1265  outer membrane efflux protein  40.67 
 
 		 481 aa  277  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2295  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  38.36 
 
 		 476 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.176348 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2657  outer membrane efflux protein  40.98 
 
 		 466 aa  266  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6292  outer membrane efflux protein  35.26 
 
 		 498 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260908 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0713  outer membrane efflux protein  39.63 
 
 		 554 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0621  outer membrane efflux protein  39.86 
 
 		 554 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2008  copper tolerance protein  39.63 
 
 		 554 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2041  outer membrane efflux protein  36.66 
 
 		 501 aa  259  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3911  outer membrane efflux protein  37.03 
 
 		 470 aa  256  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120008  normal  0.391344 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4025  outer membrane efflux protein  37.03 
 
 		 470 aa  256  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000146806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2765  outer membrane efflux protein  37.08 
 
 		 498 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1960  copper tolerance protein  39.22 
 
 		 536 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5189  outer membrane efflux protein  37.99 
 
 		 523 aa  246  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3413  outer membrane efflux protein  38.24 
 
 		 500 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4754  outer membrane efflux protein  38.24 
 
 		 500 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203593  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3352  outer membrane efflux protein  38.65 
 
 		 512 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4103  outer membrane efflux protein  39.61 
 
 		 500 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733493  normal  0.726802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6518  putative Outer membrane efflux protein  36.03 
 
 		 475 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1079  outer membrane efflux protein  37.16 
 
 		 465 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0935  outer membrane efflux protein  37.16 
 
 		 465 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.365344  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2911  copper tolerance protein  35.51 
 
 		 482 aa  210  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4384  outer membrane efflux protein  32.4 
 
 		 485 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4633  outer membrane efflux protein  31.78 
 
 		 485 aa  197  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706868  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0118  putative copper resistance protein  32.49 
 
 		 543 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4601  outer membrane efflux protein  34.16 
 
 		 475 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.332073  normal  0.615443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2578  outer membrane efflux protein  30.72 
 
 		 535 aa  193  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0560227  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4826  outer membrane efflux protein  34 
 
 		 475 aa  193  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836634  normal  0.338795 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1030  outer membrane efflux protein  30.49 
 
 		 535 aa  193  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1090  outer membrane efflux protein  31.87 
 
 		 483 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4904  outer membrane efflux protein  31.86 
 
 		 488 aa  188  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.878997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4267  copper tolerance protein  31.79 
 
 		 488 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0314  outer membrane efflux protein  29.54 
 
 		 486 aa  184  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.116177  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1209  copper tolerance protein  34.38 
 
 		 477 aa  176  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0296816  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2599  copper tolerance protein  34.72 
 
 		 477 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0277245  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9851  copper tolerance protein  31.48 
 
 		 486 aa  166  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5861  conserved hypothetical conserved membrane protein  30.6 
 
 		 488 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5028  hypothetical protein  33.59 
 
 		 487 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.924524 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7875  outer membrane efflux protein  29.14 
 
 		 483 aa  141  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639992  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1262  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  30.49 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1205  Outer membrane protein-like protein  37.38 
 
 		 438 aa  109  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2283  outer membrane efflux protein  30.08 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0495  outer membrane efflux protein  26.36 
 
 		 493 aa  73.6  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 		 547 aa  70.5  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  27.76 
 
 		 428 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.28 
 
 		 489 aa  47.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  26.69 
 
 		 428 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>