91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1960 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II1960  copper tolerance protein  100 
 
 		 536 aa  1068    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4754  outer membrane efflux protein  73.15 
 
 		 500 aa  697    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203593  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0621  outer membrane efflux protein  83.94 
 
 		 554 aa  822    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5189  outer membrane efflux protein  70.41 
 
 		 523 aa  665    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2295  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  72.65 
 
 		 476 aa  677    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.176348 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3413  outer membrane efflux protein  73.15 
 
 		 500 aa  697    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  72.44 
 
 		 486 aa  684    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0713  outer membrane efflux protein  92.83 
 
 		 554 aa  813    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2041  outer membrane efflux protein  70.45 
 
 		 501 aa  719    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2765  outer membrane efflux protein  73.56 
 
 		 498 aa  697    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3352  outer membrane efflux protein  71.32 
 
 		 512 aa  674    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2008  copper tolerance protein  93.26 
 
 		 554 aa  813    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6292  outer membrane efflux protein  75.36 
 
 		 498 aa  742    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260908 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4103  outer membrane efflux protein  73.55 
 
 		 500 aa  683    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733493  normal  0.726802 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4025  outer membrane efflux protein  65.42 
 
 		 470 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000146806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3911  outer membrane efflux protein  65.42 
 
 		 470 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120008  normal  0.391344 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0496  putative copper resistance-related lipoprotein  51.18 
 
 		 477 aa  472  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.620872 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1633  putative copper resistance-related lipoprotein  52.6 
 
 		 479 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158935 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1265  outer membrane efflux protein  51.75 
 
 		 481 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2657  outer membrane efflux protein  51.42 
 
 		 466 aa  442  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0935  outer membrane efflux protein  49.56 
 
 		 465 aa  385  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.365344  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1079  outer membrane efflux protein  49.56 
 
 		 465 aa  385  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4904  outer membrane efflux protein  43.12 
 
 		 488 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.878997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6518  putative Outer membrane efflux protein  42.77 
 
 		 475 aa  356  5e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4826  outer membrane efflux protein  45.03 
 
 		 475 aa  355  7.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836634  normal  0.338795 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4601  outer membrane efflux protein  44.34 
 
 		 475 aa  351  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.332073  normal  0.615443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4267  copper tolerance protein  42.05 
 
 		 488 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4384  outer membrane efflux protein  40.51 
 
 		 485 aa  343  5.999999999999999e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4633  outer membrane efflux protein  40.55 
 
 		 485 aa  341  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706868  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0118  putative copper resistance protein  42.23 
 
 		 543 aa  336  5.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2199  putative copper resistance-related lipoprotein  43.08 
 
 		 476 aa  334  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2670  putative copper resistance-related lipoprotein  44.4 
 
 		 476 aa  332  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0933723  normal  0.360858 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2723  putative copper resistance-related lipoprotein  42.64 
 
 		 476 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1090  outer membrane efflux protein  40.78 
 
 		 483 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3484  putative copper resistance-related lipoprotein  42.32 
 
 		 472 aa  326  7e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2578  outer membrane efflux protein  39.73 
 
 		 535 aa  320  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0560227  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1030  outer membrane efflux protein  39.73 
 
 		 535 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2911  copper tolerance protein  44.57 
 
 		 482 aa  320  5e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4553  putative copper resistance-related lipoprotein  42.38 
 
 		 472 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.910933 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5687  putative copper resistance-related lipoprotein  43.22 
 
 		 475 aa  314  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3982  putative metal ion efflux outer membrane protein  41.13 
 
 		 470 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0314  outer membrane efflux protein  38.03 
 
 		 486 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.116177  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9851  copper tolerance protein  39.61 
 
 		 486 aa  300  5e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7875  outer membrane efflux protein  40.58 
 
 		 483 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639992  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5028  hypothetical protein  39.46 
 
 		 487 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.924524 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5861  conserved hypothetical conserved membrane protein  38.08 
 
 		 488 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0736  putative copper resistance-related lipoprotein  40.38 
 
 		 475 aa  256  8e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1209  copper tolerance protein  41.91 
 
 		 477 aa  252  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0296816  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2599  copper tolerance protein  42.05 
 
 		 477 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0277245  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1262  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  35.06 
 
 		 399 aa  189  9e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  30.46 
 
 		 547 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0495  outer membrane efflux protein  29.07 
 
 		 493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1205  Outer membrane protein-like protein  36.84 
 
 		 438 aa  123  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2283  outer membrane efflux protein  28.13 
 
 		 453 aa  111  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  23.92 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  23.58 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0017  outer membrane efflux protein  24.23 
 
 		 473 aa  63.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.26 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.89 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  26.72 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  24.01 
 
 		 413 aa  57  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  21.13 
 
 		 409 aa  55.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 		 423 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  22.78 
 
 		 423 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 		 423 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  25.53 
 
 		 440 aa  54.3  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 		 394 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  24.07 
 
 		 458 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  24.81 
 
 		 432 aa  53.5  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  26.36 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  23.77 
 
 		 431 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  26.18 
 
 		 435 aa  51.2  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 		 432 aa  51.6  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  24 
 
 		 479 aa  50.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  25.57 
 
 		 432 aa  50.8  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.01 
 
 		 501 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  26.83 
 
 		 426 aa  50.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.6 
 
 		 470 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  24.17 
 
 		 467 aa  47.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  24.78 
 
 		 496 aa  47.4  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.36 
 
 		 500 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  30.11 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  22.45 
 
 		 438 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  27.1 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  29.28 
 
 		 439 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  29.28 
 
 		 439 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  25.22 
 
 		 416 aa  45.8  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  19.08 
 
 		 523 aa  45.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.04 
 
 		 434 aa  44.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  24.32 
 
 		 463 aa  43.9  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>