106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2295 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2008  copper tolerance protein  74.54 
 
 		 554 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2765  outer membrane efflux protein  73.83 
 
 		 498 aa  663    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2295  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  100 
 
 		 476 aa  959    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.176348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4754  outer membrane efflux protein  73.88 
 
 		 500 aa  655    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203593  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3413  outer membrane efflux protein  73.88 
 
 		 500 aa  655    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0713  outer membrane efflux protein  74.31 
 
 		 554 aa  654    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0621  outer membrane efflux protein  74.54 
 
 		 554 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6292  outer membrane efflux protein  79.18 
 
 		 498 aa  703    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260908 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4103  outer membrane efflux protein  72.32 
 
 		 500 aa  643    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733493  normal  0.726802 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2041  outer membrane efflux protein  78.62 
 
 		 501 aa  704    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  88.89 
 
 		 486 aa  841    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1960  copper tolerance protein  74.01 
 
 		 536 aa  632  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3352  outer membrane efflux protein  71.24 
 
 		 512 aa  631  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5189  outer membrane efflux protein  72.09 
 
 		 523 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3911  outer membrane efflux protein  65.58 
 
 		 470 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120008  normal  0.391344 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4025  outer membrane efflux protein  65.58 
 
 		 470 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000146806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0496  putative copper resistance-related lipoprotein  51.75 
 
 		 477 aa  485  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.620872 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1633  putative copper resistance-related lipoprotein  54.09 
 
 		 479 aa  482  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158935 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1265  outer membrane efflux protein  51.67 
 
 		 481 aa  457  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2657  outer membrane efflux protein  52.59 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0935  outer membrane efflux protein  49.78 
 
 		 465 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.365344  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1079  outer membrane efflux protein  49.78 
 
 		 465 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4826  outer membrane efflux protein  43.55 
 
 		 475 aa  352  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836634  normal  0.338795 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4601  outer membrane efflux protein  43.32 
 
 		 475 aa  350  5e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.332073  normal  0.615443 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4904  outer membrane efflux protein  41.93 
 
 		 488 aa  348  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.878997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4267  copper tolerance protein  41.9 
 
 		 488 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6518  putative Outer membrane efflux protein  40.35 
 
 		 475 aa  343  5.999999999999999e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4384  outer membrane efflux protein  40.92 
 
 		 485 aa  342  9e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4633  outer membrane efflux protein  39.46 
 
 		 485 aa  335  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706868  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1090  outer membrane efflux protein  41.84 
 
 		 483 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3484  putative copper resistance-related lipoprotein  41.85 
 
 		 472 aa  329  6e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2578  outer membrane efflux protein  40.32 
 
 		 535 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0560227  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2670  putative copper resistance-related lipoprotein  43.37 
 
 		 476 aa  326  6e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0933723  normal  0.360858 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1030  outer membrane efflux protein  40.09 
 
 		 535 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0118  putative copper resistance protein  40.27 
 
 		 543 aa  322  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2199  putative copper resistance-related lipoprotein  41.76 
 
 		 476 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2723  putative copper resistance-related lipoprotein  41.29 
 
 		 476 aa  317  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5687  putative copper resistance-related lipoprotein  41.82 
 
 		 475 aa  308  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0314  outer membrane efflux protein  38.02 
 
 		 486 aa  306  7e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.116177  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4553  putative copper resistance-related lipoprotein  40.31 
 
 		 472 aa  304  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.910933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2911  copper tolerance protein  41.14 
 
 		 482 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3982  putative metal ion efflux outer membrane protein  40.22 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9851  copper tolerance protein  37.66 
 
 		 486 aa  296  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7875  outer membrane efflux protein  38.95 
 
 		 483 aa  289  8e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639992  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5861  conserved hypothetical conserved membrane protein  37.31 
 
 		 488 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5028  hypothetical protein  39.05 
 
 		 487 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.924524 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1209  copper tolerance protein  40.57 
 
 		 477 aa  257  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0296816  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2599  copper tolerance protein  40.57 
 
 		 477 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0277245  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0736  putative copper resistance-related lipoprotein  39.39 
 
 		 475 aa  243  5e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1262  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  34.02 
 
 		 399 aa  201  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  29.77 
 
 		 547 aa  140  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0495  outer membrane efflux protein  27.97 
 
 		 493 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1205  Outer membrane protein-like protein  34.1 
 
 		 438 aa  113  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2283  outer membrane efflux protein  27.77 
 
 		 453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.54 
 
 		 482 aa  71.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  23.65 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  26.35 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0017  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  26.24 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  26.24 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  26.24 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  26.24 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  21.04 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.94 
 
 		 488 aa  56.2  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  24.85 
 
 		 437 aa  53.9  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  31.18 
 
 		 437 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  23.28 
 
 		 431 aa  53.5  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  25.08 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  23.49 
 
 		 440 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  24.46 
 
 		 458 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  24.05 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  22.47 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  30.65 
 
 		 439 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  30.65 
 
 		 439 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  23.98 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2373  HelC protein  23.63 
 
 		 414 aa  51.2  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  30.65 
 
 		 435 aa  51.2  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.43 
 
 		 501 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2191  outer membrane efflux protein  23.72 
 
 		 492 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  26.74 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.91 
 
 		 470 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  23.29 
 
 		 437 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  24.47 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  23.1 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.95 
 
 		 434 aa  48.5  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.67 
 
 		 500 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.11 
 
 		 493 aa  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  22.59 
 
 		 451 aa  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  26.39 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  23.62 
 
 		 432 aa  48.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  22.34 
 
 		 421 aa  47.8  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.61 
 
 		 428 aa  47.4  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  24.33 
 
 		 408 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  24.78 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.16 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0567  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.16 
 
 		 483 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  26.16 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  23.73 
 
 		 423 aa  44.3  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  23.59 
 
 		 413 aa  43.9  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>