61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3982 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3982  putative metal ion efflux outer membrane protein  100 
 
 		 470 aa  923    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3484  putative copper resistance-related lipoprotein  45.78 
 
 		 472 aa  358  9e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5687  putative copper resistance-related lipoprotein  46.83 
 
 		 475 aa  355  6.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2670  putative copper resistance-related lipoprotein  45.34 
 
 		 476 aa  355  8.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0933723  normal  0.360858 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0496  putative copper resistance-related lipoprotein  45.11 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.620872 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2723  putative copper resistance-related lipoprotein  44.04 
 
 		 476 aa  350  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2199  putative copper resistance-related lipoprotein  43.1 
 
 		 476 aa  348  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1633  putative copper resistance-related lipoprotein  45.39 
 
 		 479 aa  342  8e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158935 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4553  putative copper resistance-related lipoprotein  45.78 
 
 		 472 aa  341  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.910933 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  40.86 
 
 		 486 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1265  outer membrane efflux protein  42.19 
 
 		 481 aa  306  5.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2295  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  40.41 
 
 		 476 aa  306  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.176348 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3911  outer membrane efflux protein  40.4 
 
 		 470 aa  299  7e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120008  normal  0.391344 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4025  outer membrane efflux protein  40.4 
 
 		 470 aa  299  7e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000146806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6292  outer membrane efflux protein  39.73 
 
 		 498 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260908 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2765  outer membrane efflux protein  41.11 
 
 		 498 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2041  outer membrane efflux protein  40.04 
 
 		 501 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2657  outer membrane efflux protein  40.76 
 
 		 466 aa  293  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0713  outer membrane efflux protein  41.74 
 
 		 554 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2008  copper tolerance protein  41.97 
 
 		 554 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0621  outer membrane efflux protein  41.52 
 
 		 554 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3413  outer membrane efflux protein  40.26 
 
 		 500 aa  285  9e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4754  outer membrane efflux protein  40.26 
 
 		 500 aa  285  9e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203593  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1960  copper tolerance protein  42.2 
 
 		 536 aa  282  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4103  outer membrane efflux protein  40.31 
 
 		 500 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733493  normal  0.726802 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3352  outer membrane efflux protein  39.96 
 
 		 512 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5189  outer membrane efflux protein  39.56 
 
 		 523 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0736  putative copper resistance-related lipoprotein  42.37 
 
 		 475 aa  259  9e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6518  putative Outer membrane efflux protein  38.26 
 
 		 475 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4384  outer membrane efflux protein  35.03 
 
 		 485 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1090  outer membrane efflux protein  36.14 
 
 		 483 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4633  outer membrane efflux protein  34.17 
 
 		 485 aa  233  8.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706868  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4904  outer membrane efflux protein  36.22 
 
 		 488 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.878997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0935  outer membrane efflux protein  36.38 
 
 		 465 aa  226  7e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.365344  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1079  outer membrane efflux protein  36.38 
 
 		 465 aa  226  7e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4267  copper tolerance protein  35.08 
 
 		 488 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4601  outer membrane efflux protein  36.82 
 
 		 475 aa  224  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.332073  normal  0.615443 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2599  copper tolerance protein  37.85 
 
 		 477 aa  223  7e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0277245  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0118  putative copper resistance protein  35.02 
 
 		 543 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1209  copper tolerance protein  37.63 
 
 		 477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0296816  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4826  outer membrane efflux protein  36.82 
 
 		 475 aa  219  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836634  normal  0.338795 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2911  copper tolerance protein  36.2 
 
 		 482 aa  216  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2578  outer membrane efflux protein  33.19 
 
 		 535 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0560227  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9851  copper tolerance protein  34.24 
 
 		 486 aa  214  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1030  outer membrane efflux protein  33.33 
 
 		 535 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5861  conserved hypothetical conserved membrane protein  33.54 
 
 		 488 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5028  hypothetical protein  32.59 
 
 		 487 aa  191  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.924524 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7875  outer membrane efflux protein  32.29 
 
 		 483 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639992  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0314  outer membrane efflux protein  32.47 
 
 		 486 aa  183  7e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.116177  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1262  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  35.97 
 
 		 399 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1205  Outer membrane protein-like protein  35.45 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2283  outer membrane efflux protein  29.7 
 
 		 453 aa  106  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  27.76 
 
 		 547 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0495  outer membrane efflux protein  26.93 
 
 		 493 aa  76.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.09 
 
 		 488 aa  51.6  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  25.41 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  29.77 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  27.22 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1551  outer membrane efflux protein  27.6 
 
 		 443 aa  45.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  26.67 
 
 		 423 aa  43.5  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  27.33 
 
 		 432 aa  43.5  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>