117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0495 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0495  outer membrane efflux protein  100 
 
 
493 aa  982    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  71.68 
 
 
547 aa  633  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6292  outer membrane efflux protein  29.33 
 
 
498 aa  152  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.260908 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  27.43 
 
 
486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4025  outer membrane efflux protein  29.07 
 
 
470 aa  140  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000146806  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3911  outer membrane efflux protein  29.07 
 
 
470 aa  140  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120008  normal  0.391344 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2041  outer membrane efflux protein  28.16 
 
 
501 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2295  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  27.6 
 
 
476 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.176348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4754  outer membrane efflux protein  29.27 
 
 
500 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203593  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3413  outer membrane efflux protein  29.27 
 
 
500 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2765  outer membrane efflux protein  31.17 
 
 
498 aa  133  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4103  outer membrane efflux protein  30.75 
 
 
500 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733493  normal  0.726802 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3352  outer membrane efflux protein  30.6 
 
 
512 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0713  outer membrane efflux protein  30.73 
 
 
554 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2008  copper tolerance protein  30.73 
 
 
554 aa  126  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0935  outer membrane efflux protein  29.32 
 
 
465 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.365344  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1079  outer membrane efflux protein  29.32 
 
 
465 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0621  outer membrane efflux protein  30.58 
 
 
554 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5189  outer membrane efflux protein  29.71 
 
 
523 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0496  putative copper resistance-related lipoprotein  28.1 
 
 
477 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.620872 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1960  copper tolerance protein  30.35 
 
 
536 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2657  outer membrane efflux protein  28.17 
 
 
466 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763881  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4384  outer membrane efflux protein  25.77 
 
 
485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4633  outer membrane efflux protein  26.15 
 
 
485 aa  114  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706868  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1633  putative copper resistance-related lipoprotein  25.84 
 
 
479 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.158935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1090  outer membrane efflux protein  28.23 
 
 
483 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0314  outer membrane efflux protein  28.38 
 
 
486 aa  107  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.116177  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6518  putative Outer membrane efflux protein  28.66 
 
 
475 aa  106  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753245  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0118  putative copper resistance protein  27.18 
 
 
543 aa  106  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1265  outer membrane efflux protein  28.53 
 
 
481 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4267  copper tolerance protein  27.36 
 
 
488 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4601  outer membrane efflux protein  27.31 
 
 
475 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.332073  normal  0.615443 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2283  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 
453 aa  100  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2911  copper tolerance protein  29.42 
 
 
482 aa  99.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4826  outer membrane efflux protein  27.09 
 
 
475 aa  98.2  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836634  normal  0.338795 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4904  outer membrane efflux protein  26.2 
 
 
488 aa  98.2  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.878997  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2670  putative copper resistance-related lipoprotein  25.27 
 
 
476 aa  95.5  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0933723  normal  0.360858 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3982  putative metal ion efflux outer membrane protein  27.07 
 
 
470 aa  95.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5028  hypothetical protein  28.07 
 
 
487 aa  94  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.924524 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9851  copper tolerance protein  26.88 
 
 
486 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5687  putative copper resistance-related lipoprotein  26.57 
 
 
475 aa  91.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2723  putative copper resistance-related lipoprotein  24.45 
 
 
476 aa  91.3  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3484  putative copper resistance-related lipoprotein  24.79 
 
 
472 aa  90.1  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5861  conserved hypothetical conserved membrane protein  26.68 
 
 
488 aa  87.8  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2199  putative copper resistance-related lipoprotein  24.45 
 
 
476 aa  84.7  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1209  copper tolerance protein  27.98 
 
 
477 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0296816  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7875  outer membrane efflux protein  25.49 
 
 
483 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639992  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2599  copper tolerance protein  27.83 
 
 
477 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0277245  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4553  putative copper resistance-related lipoprotein  23.36 
 
 
472 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.910933 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  25.71 
 
 
438 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  23.8 
 
 
440 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2037  outer membrane efflux protein  30.51 
 
 
449 aa  70.1  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.621785  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1701  outer membrane efflux protein  30.51 
 
 
449 aa  70.1  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.103741  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.33 
 
 
428 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1030  outer membrane efflux protein  23.23 
 
 
535 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  27 
 
 
438 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.9 
 
 
434 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0736  putative copper resistance-related lipoprotein  26.68 
 
 
475 aa  65.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  23.95 
 
 
437 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  23.95 
 
 
439 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  23.95 
 
 
439 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2578  outer membrane efflux protein  24.45 
 
 
535 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0560227  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  24.35 
 
 
426 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  24.31 
 
 
446 aa  64.7  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  27.62 
 
 
415 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.09 
 
 
437 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  23.68 
 
 
435 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  24.1 
 
 
443 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  24.19 
 
 
431 aa  60.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  23.63 
 
 
428 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  23.76 
 
 
458 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  22.69 
 
 
428 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1630  outer membrane efflux protein  28.99 
 
 
483 aa  54.7  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0405994 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2191  outer membrane efflux protein  24.87 
 
 
492 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  22.89 
 
 
437 aa  53.9  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  21.85 
 
 
451 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 
443 aa  52.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  24.49 
 
 
423 aa  52.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0185  outer membrane efflux protein  26.88 
 
 
485 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  22.3 
 
 
472 aa  51.2  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2564  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.91 
 
 
495 aa  51.2  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248386  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  26.15 
 
 
432 aa  50.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3501  Outer membrane efflux protein  24.62 
 
 
489 aa  50.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  22.22 
 
 
423 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 
423 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 
423 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 
394 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  22.42 
 
 
421 aa  49.3  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  23.84 
 
 
432 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  24.55 
 
 
418 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  24.78 
 
 
432 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  24.55 
 
 
418 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  23.04 
 
 
431 aa  48.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  20.25 
 
 
438 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  21.98 
 
 
423 aa  47.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3836  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmvC  25.35 
 
 
445 aa  47  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2567  outer membrane efflux protein  26.6 
 
 
433 aa  47  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1768  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  25.81 
 
 
434 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3274  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.03 
 
 
495 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1343  outer membrane efflux protein  26.03 
 
 
429 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>