60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7875 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7875  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 483 aa  955    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639992  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4904  outer membrane efflux protein  62.85 
 
 		 488 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.878997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4826  outer membrane efflux protein  61.73 
 
 		 475 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836634  normal  0.338795 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4601  outer membrane efflux protein  61.96 
 
 		 475 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.332073  normal  0.615443 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4384  outer membrane efflux protein  46.39 
 
 		 485 aa  395  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4633  outer membrane efflux protein  46.43 
 
 		 485 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706868  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2578  outer membrane efflux protein  44.8 
 
 		 535 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0560227  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1030  outer membrane efflux protein  47.09 
 
 		 535 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4267  copper tolerance protein  45.35 
 
 		 488 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6518  putative Outer membrane efflux protein  46.82 
 
 		 475 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0118  putative copper resistance protein  41.85 
 
 		 543 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0314  outer membrane efflux protein  44.78 
 
 		 486 aa  358  9.999999999999999e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.116177  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1090  outer membrane efflux protein  41.4 
 
 		 483 aa  346  6e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9851  copper tolerance protein  42.54 
 
 		 486 aa  310  5e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  38.79 
 
 		 486 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5861  conserved hypothetical conserved membrane protein  42.56 
 
 		 488 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6292  outer membrane efflux protein  39.78 
 
 		 498 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260908 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2295  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  39.06 
 
 		 476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.176348 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2765  outer membrane efflux protein  39.55 
 
 		 498 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5028  hypothetical protein  42.38 
 
 		 487 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.924524 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2041  outer membrane efflux protein  37.67 
 
 		 501 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4754  outer membrane efflux protein  39.61 
 
 		 500 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203593  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3413  outer membrane efflux protein  39.61 
 
 		 500 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0713  outer membrane efflux protein  40.05 
 
 		 554 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0621  outer membrane efflux protein  40.27 
 
 		 554 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3911  outer membrane efflux protein  40.36 
 
 		 470 aa  289  9e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120008  normal  0.391344 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4025  outer membrane efflux protein  40.36 
 
 		 470 aa  289  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000146806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2008  copper tolerance protein  40.27 
 
 		 554 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4103  outer membrane efflux protein  39.64 
 
 		 500 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733493  normal  0.726802 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5189  outer membrane efflux protein  39.65 
 
 		 523 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0496  putative copper resistance-related lipoprotein  37.92 
 
 		 477 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.620872 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1633  putative copper resistance-related lipoprotein  37.98 
 
 		 479 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158935 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3352  outer membrane efflux protein  39 
 
 		 512 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1960  copper tolerance protein  40.58 
 
 		 536 aa  282  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1265  outer membrane efflux protein  38.23 
 
 		 481 aa  269  8.999999999999999e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2657  outer membrane efflux protein  37.21 
 
 		 466 aa  254  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0935  outer membrane efflux protein  36.32 
 
 		 465 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.365344  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1079  outer membrane efflux protein  36.32 
 
 		 465 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2911  copper tolerance protein  34.2 
 
 		 482 aa  224  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3484  putative copper resistance-related lipoprotein  34.04 
 
 		 472 aa  201  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3982  putative metal ion efflux outer membrane protein  32.29 
 
 		 470 aa  191  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2199  putative copper resistance-related lipoprotein  31.34 
 
 		 476 aa  189  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2723  putative copper resistance-related lipoprotein  31.4 
 
 		 476 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2599  copper tolerance protein  33.11 
 
 		 477 aa  177  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0277245  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1209  copper tolerance protein  33.11 
 
 		 477 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0296816  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2670  putative copper resistance-related lipoprotein  32.03 
 
 		 476 aa  169  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0933723  normal  0.360858 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4553  putative copper resistance-related lipoprotein  31.21 
 
 		 472 aa  169  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.910933 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5687  putative copper resistance-related lipoprotein  30.82 
 
 		 475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1262  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  30.67 
 
 		 399 aa  150  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0736  putative copper resistance-related lipoprotein  29.89 
 
 		 475 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  28.88 
 
 		 547 aa  95.9  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1205  Outer membrane protein-like protein  31.83 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2283  outer membrane efflux protein  27.85 
 
 		 453 aa  80.1  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0495  outer membrane efflux protein  25.21 
 
 		 493 aa  70.9  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  25.96 
 
 		 503 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  27.03 
 
 		 435 aa  47.4  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5588  putative outer membrane efflux protein MdtP  26.89 
 
 		 488 aa  44.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4544  putative outer membrane efflux protein MdtP  26.89 
 
 		 488 aa  44.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4325  putative outer membrane efflux protein MdtP  26.89 
 
 		 488 aa  44.3  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4637  putative outer membrane efflux protein MdtP  26.89 
 
 		 488 aa  44.3  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>