151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2225 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 547 aa  1080    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0495  outer membrane efflux protein  69.23 
 
 		 493 aa  617  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6292  outer membrane efflux protein  28.7 
 
 		 498 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260908 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2295  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  29.85 
 
 		 476 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.176348 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  27.77 
 
 		 486 aa  140  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2008  copper tolerance protein  31.65 
 
 		 554 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0713  outer membrane efflux protein  31.65 
 
 		 554 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4025  outer membrane efflux protein  29.74 
 
 		 470 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000146806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3911  outer membrane efflux protein  29.74 
 
 		 470 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120008  normal  0.391344 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2765  outer membrane efflux protein  30.51 
 
 		 498 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0621  outer membrane efflux protein  30.87 
 
 		 554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0496  putative copper resistance-related lipoprotein  29.04 
 
 		 477 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.620872 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2041  outer membrane efflux protein  30.18 
 
 		 501 aa  134  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2657  outer membrane efflux protein  30.83 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1633  putative copper resistance-related lipoprotein  28.51 
 
 		 479 aa  127  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158935 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1960  copper tolerance protein  30.48 
 
 		 536 aa  126  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3352  outer membrane efflux protein  31.09 
 
 		 512 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0314  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 		 486 aa  126  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.116177  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5189  outer membrane efflux protein  31.35 
 
 		 523 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4103  outer membrane efflux protein  29.67 
 
 		 500 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733493  normal  0.726802 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4754  outer membrane efflux protein  29.67 
 
 		 500 aa  124  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203593  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3413  outer membrane efflux protein  29.67 
 
 		 500 aa  124  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1265  outer membrane efflux protein  30.73 
 
 		 481 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0935  outer membrane efflux protein  28.88 
 
 		 465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.365344  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1079  outer membrane efflux protein  28.88 
 
 		 465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4384  outer membrane efflux protein  27.33 
 
 		 485 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2911  copper tolerance protein  30.39 
 
 		 482 aa  114  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4601  outer membrane efflux protein  29.64 
 
 		 475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.332073  normal  0.615443 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4633  outer membrane efflux protein  26.68 
 
 		 485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706868  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6518  putative Outer membrane efflux protein  29.34 
 
 		 475 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4826  outer membrane efflux protein  29.64 
 
 		 475 aa  109  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836634  normal  0.338795 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4904  outer membrane efflux protein  29.82 
 
 		 488 aa  109  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.878997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2283  outer membrane efflux protein  28.28 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1090  outer membrane efflux protein  27.19 
 
 		 483 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  63.64 
 
 		 717 aa  106  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0118  putative copper resistance protein  26.95 
 
 		 543 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5028  hypothetical protein  29.31 
 
 		 487 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.924524 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3982  putative metal ion efflux outer membrane protein  28.64 
 
 		 470 aa  101  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4267  copper tolerance protein  28.33 
 
 		 488 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9851  copper tolerance protein  28.24 
 
 		 486 aa  96.3  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3484  putative copper resistance-related lipoprotein  27.32 
 
 		 472 aa  96.3  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5861  conserved hypothetical conserved membrane protein  28.5 
 
 		 488 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2670  putative copper resistance-related lipoprotein  28.21 
 
 		 476 aa  95.5  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0933723  normal  0.360858 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5687  putative copper resistance-related lipoprotein  27.54 
 
 		 475 aa  93.6  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2199  putative copper resistance-related lipoprotein  26.17 
 
 		 476 aa  89.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4553  putative copper resistance-related lipoprotein  27.91 
 
 		 472 aa  86.7  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.910933 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7875  outer membrane efflux protein  27.53 
 
 		 483 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639992  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2723  putative copper resistance-related lipoprotein  24.89 
 
 		 476 aa  85.9  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2599  copper tolerance protein  29.25 
 
 		 477 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0277245  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1209  copper tolerance protein  29.16 
 
 		 477 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0296816  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  30.02 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  32.63 
 
 		 688 aa  70.5  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2037  outer membrane efflux protein  31.6 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.621785  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1701  outer membrane efflux protein  31.6 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.103741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  47.62 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.87 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  25.33 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  26.32 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  25.91 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1043  ABC transporter substrate-binding protein  55.74 
 
 		 516 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.34335  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1354  sulfatase  52.86 
 
 		 621 aa  64.3  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 440 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1630  outer membrane efflux protein  26.6 
 
 		 483 aa  62  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0405994 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  42.86 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11341  ABC transporter substrate-binding protein  56.9 
 
 		 513 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472786  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  41.38 
 
 		 523 aa  61.6  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  25.15 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  25.88 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  25.88 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  43.84 
 
 		 644 aa  60.1  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  26.13 
 
 		 437 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  25.67 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  26.09 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  35.24 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  34.94 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  32.14 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  37.08 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  38.89 
 
 		 645 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  37.08 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  42.86 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  36.26 
 
 		 451 aa  57  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  26.33 
 
 		 458 aa  57  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2191  outer membrane efflux protein  26.2 
 
 		 492 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0736  putative copper resistance-related lipoprotein  25.71 
 
 		 475 aa  56.6  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  25.92 
 
 		 435 aa  56.6  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  36.26 
 
 		 437 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.71 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  39.53 
 
 		 366 aa  56.2  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  27.17 
 
 		 438 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  37.5 
 
 		 434 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  37.08 
 
 		 2851 aa  55.1  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  37.68 
 
 		 308 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  38.18 
 
 		 382 aa  54.7  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  36.26 
 
 		 438 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  37.5 
 
 		 442 aa  54.3  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  36.26 
 
 		 437 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  23.59 
 
 		 446 aa  53.9  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2843  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 		 489 aa  53.5  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  32.69 
 
 		 400 aa  53.5  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>