32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1701 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2037  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 449 aa  895    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.621785  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1701  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 449 aa  895    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.103741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1937  outer membrane efflux protein  47.09 
 
 		 461 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2191  outer membrane efflux protein  31.58 
 
 		 492 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0310  outer membrane efflux protein  31.87 
 
 		 453 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3164  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0786  outer membrane efflux protein  29.02 
 
 		 452 aa  100  8e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.82 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  28.38 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  26.97 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  29.7 
 
 		 547 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  25.55 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  28.03 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  25.38 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1630  outer membrane efflux protein  25.07 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0405994 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0495  outer membrane efflux protein  30.33 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  21.88 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0185  outer membrane efflux protein  25.78 
 
 		 485 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.09 
 
 		 437 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  24.67 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6292  outer membrane efflux protein  21.47 
 
 		 498 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260908 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2295  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  23.08 
 
 		 476 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.176348 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.1 
 
 		 493 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  22.58 
 
 		 437 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2578  outer membrane efflux protein  25.89 
 
 		 535 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0560227  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1854  putative outer membrane multidrug resistance lipoprotein  29.82 
 
 		 475 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3108  outer membrane efflux protein  26.63 
 
 		 458 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  26.21 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1061  Outer membrane protein-like protein  35.53 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.855536 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0314  outer membrane efflux protein  29.39 
 
 		 486 aa  43.5  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.116177  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1079  outer membrane efflux protein  26.37 
 
 		 465 aa  43.5  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0935  outer membrane efflux protein  26.37 
 
 		 465 aa  43.5  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.365344  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1186  divalent cation resistant determinant protein C, putative  23.51 
 
 		 511 aa  43.1  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>