45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3108 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3108  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 458 aa  902    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2737  outer membrane efflux protein  65.28 
 
 		 467 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0703176  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0185  outer membrane efflux protein  31.88 
 
 		 485 aa  159  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1630  outer membrane efflux protein  28.42 
 
 		 483 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0405994 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1186  divalent cation resistant determinant protein C, putative  30.94 
 
 		 511 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2037  outer membrane efflux protein  27.21 
 
 		 449 aa  75.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.621785  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1701  outer membrane efflux protein  27.21 
 
 		 449 aa  75.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.103741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.88 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2191  outer membrane efflux protein  26.16 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  24.8 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  25.81 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  24.73 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1937  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.66 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  28.01 
 
 		 442 aa  50.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  25.2 
 
 		 443 aa  50.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  25.9 
 
 		 426 aa  50.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  23.71 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1061  Outer membrane protein-like protein  26.72 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.855536 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  29.84 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  26.42 
 
 		 423 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  26.42 
 
 		 423 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  26.42 
 
 		 423 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  21.94 
 
 		 431 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2477  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.64 
 
 		 484 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  24.41 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0786  outer membrane efflux protein  25.35 
 
 		 452 aa  45.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  21.89 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  25.89 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  26.42 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  29.37 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6208  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.98 
 
 		 497 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.842439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2284  outer membrane efflux protein  28.97 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27410  putative outer membrane protein precursor  26.02 
 
 		 479 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.721932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2577  outer membrane efflux protein  33.09 
 
 		 435 aa  44.3  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  24.52 
 
 		 485 aa  43.9  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.55701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  31.17 
 
 		 438 aa  43.9  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  25.56 
 
 		 458 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0141  RND efflux system, outer membrane protein  25.95 
 
 		 506 aa  43.9  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1037  RND efflux system, outer membrane protein  25.9 
 
 		 508 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0168  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  25.9 
 
 		 508 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0618806  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2631  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  25.9 
 
 		 508 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  33.59 
 
 		 422 aa  43.5  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1312  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  25.9 
 
 		 508 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2774  Outer membrane protein  25.9 
 
 		 508 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>