64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2737 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2737  outer membrane efflux protein  100 
 
 
467 aa  870    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0703176  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3108  outer membrane efflux protein  64.58 
 
 
458 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0185  outer membrane efflux protein  32.8 
 
 
485 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1630  outer membrane efflux protein  29.58 
 
 
483 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0405994 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1186  divalent cation resistant determinant protein C, putative  33.7 
 
 
511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  29.62 
 
 
428 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  28.73 
 
 
423 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  26.46 
 
 
479 aa  64.7  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
437 aa  63.9  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  27.66 
 
 
426 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  29.01 
 
 
423 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  28.9 
 
 
422 aa  61.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1701  outer membrane efflux protein  26.02 
 
 
449 aa  61.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.103741  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2037  outer membrane efflux protein  26.02 
 
 
449 aa  61.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.621785  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2191  outer membrane efflux protein  27.45 
 
 
492 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  27.89 
 
 
423 aa  60.1  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4652  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.64 
 
 
464 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  27.65 
 
 
438 aa  57.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1937  outer membrane efflux protein  28.13 
 
 
461 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  29.7 
 
 
435 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  29.61 
 
 
423 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1061  Outer membrane protein-like protein  30 
 
 
426 aa  54.7  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.855536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  29.52 
 
 
423 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0786  outer membrane efflux protein  27.06 
 
 
452 aa  52.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  27.01 
 
 
431 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.11 
 
 
437 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  27.78 
 
 
547 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  28.76 
 
 
424 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  25.19 
 
 
415 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3433  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.27 
 
 
477 aa  50.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2695  outer membrane efflux protein  25.09 
 
 
512 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  28.53 
 
 
423 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  24.33 
 
 
421 aa  49.3  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2577  outer membrane efflux protein  35.14 
 
 
435 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3497  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.19 
 
 
470 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.81 
 
 
546 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16116  normal  0.32958 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  24.81 
 
 
423 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  24.81 
 
 
423 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  24.81 
 
 
423 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  29.04 
 
 
423 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  24.81 
 
 
394 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4684  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.21 
 
 
494 aa  47  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0667  outer membrane efflux protein  29.64 
 
 
478 aa  47  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.78 
 
 
452 aa  47  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  26.42 
 
 
458 aa  47  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  25.53 
 
 
425 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  23.92 
 
 
416 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1827  outer membrane efflux protein  24.92 
 
 
496 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.115006  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1877  Outer membrane efflux protein  28.77 
 
 
413 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2169  outer membrane toxin secretion efflux protein, putative  24.92 
 
 
496 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  25.2 
 
 
431 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  25.25 
 
 
416 aa  45.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4293  outer membrane efflux protein  22.09 
 
 
412 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.730588  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  27.04 
 
 
443 aa  45.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0811  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.39 
 
 
517 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6550  outer membrane efflux protein  26.58 
 
 
433 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125608  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2386  RND family efflux transporter outer membrane lipoprotein  21.01 
 
 
479 aa  44.3  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0682208  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3369  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.22 
 
 
489 aa  44.3  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413443  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  24.35 
 
 
418 aa  44.3  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.94 
 
 
474 aa  43.9  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2284  outer membrane efflux protein  34.23 
 
 
420 aa  43.9  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185931  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  24.35 
 
 
418 aa  43.9  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.63 
 
 
471 aa  43.5  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6208  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.02 
 
 
497 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.842439  normal  0.408471 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>