19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0786 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0786  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 452 aa  893    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2191  outer membrane efflux protein  32.06 
 
 		 492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2037  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 		 449 aa  95.1  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.621785  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1701  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 		 449 aa  95.1  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.103741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1937  outer membrane efflux protein  25.28 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  23.5 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0310  outer membrane efflux protein  37.76 
 
 		 453 aa  55.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3164  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  24.7 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4293  outer membrane efflux protein  27.71 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.730588  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3454  outer membrane efflux protein  24.35 
 
 		 477 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00515771  hitchhiker  0.00444269 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.87 
 
 		 428 aa  47.4  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  27.17 
 
 		 528 aa  45.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0822  outer membrane efflux family protein  24.35 
 
 		 472 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 432 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1957  putative RND efflux system protein  21.66 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.07 
 
 		 452 aa  44.3  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1176  Outer membrane efflux protein  25 
 
 		 429 aa  44.3  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0143  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.54 
 
 		 541 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.302016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>