27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1937 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1937  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 461 aa  909    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2037  outer membrane efflux protein  47.09 
 
 		 449 aa  334  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.621785  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1701  outer membrane efflux protein  47.09 
 
 		 449 aa  334  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.103741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2191  outer membrane efflux protein  30.02 
 
 		 492 aa  154  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0310  outer membrane efflux protein  34.58 
 
 		 453 aa  98.2  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3164  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0786  outer membrane efflux protein  25.78 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  28.07 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  29.31 
 
 		 434 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0185  outer membrane efflux protein  26.96 
 
 		 485 aa  59.7  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  26.76 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 		 431 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  22.57 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  25.54 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  24.66 
 
 		 432 aa  51.2  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  25.26 
 
 		 432 aa  50.1  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  27.15 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2394  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  26.86 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.794005  hitchhiker  0.00223071 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1061  Outer membrane protein-like protein  23.09 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.855536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  26.42 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  26.39 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2295  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  26.52 
 
 		 476 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.176348 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  26.4 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 432 aa  44.3  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1186  divalent cation resistant determinant protein C, putative  31.51 
 
 		 511 aa  43.5  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  33.61 
 
 		 547 aa  43.5  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6292  outer membrane efflux protein  27.5 
 
 		 498 aa  43.1  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>