187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0310 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0310  outer membrane efflux protein  100 
 
 
453 aa  817    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3164  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2191  outer membrane efflux protein  31.97 
 
 
492 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1701  outer membrane efflux protein  34.48 
 
 
449 aa  138  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.103741  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2037  outer membrane efflux protein  34.48 
 
 
449 aa  138  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.621785  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1937  outer membrane efflux protein  35.2 
 
 
461 aa  125  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0786  outer membrane efflux protein  29 
 
 
452 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2713  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.42 
 
 
477 aa  63.2  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.15 
 
 
486 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.02 
 
 
478 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.09 
 
 
486 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4305  outer membrane efflux protein  24.31 
 
 
486 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4998  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.74 
 
 
515 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2127  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.97 
 
 
513 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.97 
 
 
477 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.69 
 
 
472 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28780  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.49 
 
 
512 aa  58.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506262  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.66 
 
 
525 aa  57  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3473  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.66 
 
 
525 aa  57  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0809824  normal  0.12883 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1464  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.72 
 
 
510 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0567  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.57 
 
 
483 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1842  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.72 
 
 
510 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14360  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.5 
 
 
507 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.10675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0418  outer membrane efflux protein OprC  31.72 
 
 
510 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2912  hypothetical protein  27.8 
 
 
533 aa  54.7  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1695  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.38 
 
 
512 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.1 
 
 
516 aa  55.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0829  outer membrane efflux protein OprC  31.72 
 
 
510 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  27.39 
 
 
432 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2146  outer membrane efflux protein OprC  31.72 
 
 
510 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0515  outer membrane efflux protein OprC  31.72 
 
 
510 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.93 
 
 
482 aa  54.3  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2104  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.07 
 
 
510 aa  54.3  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.409236  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1737  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.45 
 
 
509 aa  54.3  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1884  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.94 
 
 
464 aa  53.1  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0017284  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  34.27 
 
 
491 aa  53.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4486  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.35 
 
 
512 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.42 
 
 
489 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670028  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2428  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.74 
 
 
509 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.440095 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.61 
 
 
500 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0358  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.95 
 
 
509 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4536  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.95 
 
 
533 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748568  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3375  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31 
 
 
517 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0151483  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0079  hypothetical protein  26.77 
 
 
479 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4920  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31 
 
 
513 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31782  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.04 
 
 
477 aa  51.2  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.321053 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3016  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31 
 
 
513 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5350  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31 
 
 
513 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00199019  normal  0.49097 
 
 
-
 
NC_003296  RS01780  outer membrane CHANEL lipoprotein  31.17 
 
 
522 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.85 
 
 
470 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0851  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.95 
 
 
537 aa  51.2  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238751  hitchhiker  0.00377502 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4697  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.44 
 
 
513 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204697  normal  0.315368 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0925  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  31.19 
 
 
460 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2819  outer membrane protein OprJ  28.42 
 
 
468 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.980235 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5238  outer membrane protein OprM  30.84 
 
 
475 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5228  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.44 
 
 
513 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.14 
 
 
471 aa  50.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0834  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  31.19 
 
 
460 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3486  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.73 
 
 
500 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0233233 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2184  outer membrane efflux protein  31.19 
 
 
460 aa  50.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1186  divalent cation resistant determinant protein C, putative  28.46 
 
 
511 aa  50.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1061  Outer membrane protein-like protein  24.03 
 
 
426 aa  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.855536 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4088  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.09 
 
 
489 aa  50.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.947344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3798  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.47 
 
 
462 aa  50.1  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.9 
 
 
467 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41681  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31 
 
 
511 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2559  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.84 
 
 
527 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  28.28 
 
 
470 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1750  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.18 
 
 
498 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0410029 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4297  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  25.89 
 
 
461 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00173675  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1124  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.72 
 
 
509 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.405736 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1215  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.05 
 
 
509 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156046  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1818  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.95 
 
 
482 aa  49.3  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.332659  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0259  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  25.89 
 
 
461 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.19 
 
 
437 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2756  outer membrane efflux protein  29.11 
 
 
490 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.67 
 
 
487 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3369  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.47 
 
 
489 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413443  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30 
 
 
452 aa  48.9  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.27 
 
 
498 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0987986 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.9 
 
 
501 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1921  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.67 
 
 
514 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330678  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1031  ABC-type export system, outer membrane channel protein  31.72 
 
 
494 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1056  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.94 
 
 
498 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14613  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1577  outer membrane efflux protein, OprM  28.72 
 
 
606 aa  47.8  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000543553  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  28.69 
 
 
738 aa  47.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0996  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.94 
 
 
498 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1948  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.19 
 
 
495 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  26.81 
 
 
485 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.67 
 
 
514 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0170  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.94 
 
 
498 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0737823  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1745  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  30.67 
 
 
498 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1768  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  36.94 
 
 
493 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2623  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  31.72 
 
 
494 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1387  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.27 
 
 
498 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60820  outer membrane protein OprJ  30.49 
 
 
479 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1854  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  29.62 
 
 
615 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  28.31 
 
 
500 aa  47  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  26.45 
 
 
485 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3811  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.92 
 
 
476 aa  47.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.521708  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1678  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  29.62 
 
 
594 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>