148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1186 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1186  divalent cation resistant determinant protein C, putative  100 
 
 
511 aa  1007    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0185  outer membrane efflux protein  39.32 
 
 
485 aa  249  9e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1630  outer membrane efflux protein  33.55 
 
 
483 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0405994 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3108  outer membrane efflux protein  33.33 
 
 
458 aa  107  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  28.43 
 
 
437 aa  97.4  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  26.86 
 
 
426 aa  94.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  27.39 
 
 
431 aa  93.2  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  26.99 
 
 
418 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  26.58 
 
 
418 aa  88.2  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2191  outer membrane efflux protein  26.09 
 
 
492 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  29.47 
 
 
428 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.91 
 
 
437 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 
423 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  28.18 
 
 
428 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  27.62 
 
 
428 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  27.11 
 
 
415 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  28.28 
 
 
440 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
451 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  27.36 
 
 
425 aa  75.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  30.51 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  29.05 
 
 
443 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  27.08 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  25.85 
 
 
408 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 
442 aa  71.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  26.17 
 
 
438 aa  71.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  26.94 
 
 
421 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  28.31 
 
 
458 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  31.16 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  25.45 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  26.8 
 
 
472 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  23.06 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3501  Outer membrane efflux protein  29.75 
 
 
489 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  28 
 
 
479 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  24.55 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  26.7 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.06 
 
 
434 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  29.23 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  25.94 
 
 
431 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  23.79 
 
 
394 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1937  outer membrane efflux protein  26.52 
 
 
461 aa  65.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  25.64 
 
 
433 aa  65.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  29.13 
 
 
452 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  29.13 
 
 
443 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  24.2 
 
 
438 aa  65.1  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  25 
 
 
424 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  29.13 
 
 
461 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  29.13 
 
 
461 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  29.13 
 
 
461 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  29.13 
 
 
461 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  28.87 
 
 
443 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1061  Outer membrane protein-like protein  23.53 
 
 
426 aa  63.5  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.855536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  27.1 
 
 
439 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  27.1 
 
 
439 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1176  Outer membrane efflux protein  26.54 
 
 
429 aa  62.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  26.3 
 
 
443 aa  62.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  26.18 
 
 
425 aa  61.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  24.87 
 
 
432 aa  61.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  25.06 
 
 
424 aa  61.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  27.3 
 
 
437 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3709  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.01 
 
 
485 aa  60.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2843  outer membrane efflux protein  26.34 
 
 
489 aa  60.8  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2737  outer membrane efflux protein  35.77 
 
 
467 aa  60.5  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0703176  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  27.6 
 
 
547 aa  60.1  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  26.14 
 
 
423 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0786  outer membrane efflux protein  27.29 
 
 
452 aa  59.7  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  29.19 
 
 
435 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  23.33 
 
 
426 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  27.04 
 
 
423 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  27.79 
 
 
441 aa  57.4  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2819  outer membrane protein OprJ  28.1 
 
 
468 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.980235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.01 
 
 
467 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41681  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  25.23 
 
 
435 aa  54.7  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3836  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmvC  29.18 
 
 
445 aa  54.7  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  27.57 
 
 
448 aa  54.7  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  23.05 
 
 
471 aa  54.3  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0495  outer membrane efflux protein  27.57 
 
 
493 aa  53.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2803  outer membrane efflux protein  27.19 
 
 
412 aa  52.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.887689  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  27.42 
 
 
433 aa  52.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2830  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.65 
 
 
455 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0538261  hitchhiker  0.00247347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1293  outer membrane efflux protein  24.61 
 
 
442 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.803504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  28.14 
 
 
407 aa  51.2  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  28.51 
 
 
432 aa  51.2  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  25.82 
 
 
438 aa  51.6  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  26.12 
 
 
443 aa  50.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1551  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 
443 aa  51.2  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  25.09 
 
 
435 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  21.75 
 
 
423 aa  50.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  21.56 
 
 
423 aa  50.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  26.99 
 
 
441 aa  50.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000983275  unclonable  0.000000000104798 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  26.37 
 
 
435 aa  50.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1267  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  26.44 
 
 
512 aa  50.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0522165  normal  0.0121166 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  25.09 
 
 
435 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  25.09 
 
 
435 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  25.09 
 
 
435 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1845  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.78 
 
 
471 aa  50.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000390204  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1701  outer membrane efflux protein  24.5 
 
 
449 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.103741  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2037  outer membrane efflux protein  24.5 
 
 
449 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.621785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>