66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0314 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0314  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 486 aa  969    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.116177  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2578  outer membrane efflux protein  51.33 
 
 		 535 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0560227  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1030  outer membrane efflux protein  50.56 
 
 		 535 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4904  outer membrane efflux protein  45.51 
 
 		 488 aa  395  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.878997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4826  outer membrane efflux protein  48.08 
 
 		 475 aa  382  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836634  normal  0.338795 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4601  outer membrane efflux protein  48.31 
 
 		 475 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.332073  normal  0.615443 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4633  outer membrane efflux protein  45.45 
 
 		 485 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706868  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1090  outer membrane efflux protein  45.59 
 
 		 483 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6518  putative Outer membrane efflux protein  46.47 
 
 		 475 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4384  outer membrane efflux protein  44.59 
 
 		 485 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4267  copper tolerance protein  46.15 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0118  putative copper resistance protein  45.15 
 
 		 543 aa  355  7.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7875  outer membrane efflux protein  44.83 
 
 		 483 aa  349  7e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639992  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  38.57 
 
 		 486 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2765  outer membrane efflux protein  39.74 
 
 		 498 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6292  outer membrane efflux protein  38.8 
 
 		 498 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260908 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2295  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  37.8 
 
 		 476 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.176348 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4025  outer membrane efflux protein  38.78 
 
 		 470 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000146806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3911  outer membrane efflux protein  38.78 
 
 		 470 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120008  normal  0.391344 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2008  copper tolerance protein  39.37 
 
 		 554 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0621  outer membrane efflux protein  39.37 
 
 		 554 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0713  outer membrane efflux protein  39.37 
 
 		 554 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4754  outer membrane efflux protein  39.01 
 
 		 500 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203593  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3413  outer membrane efflux protein  39.01 
 
 		 500 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1633  putative copper resistance-related lipoprotein  37.53 
 
 		 479 aa  292  9e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158935 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4103  outer membrane efflux protein  38.7 
 
 		 500 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733493  normal  0.726802 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2041  outer membrane efflux protein  37 
 
 		 501 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5861  conserved hypothetical conserved membrane protein  39.92 
 
 		 488 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5189  outer membrane efflux protein  39.52 
 
 		 523 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1960  copper tolerance protein  38.05 
 
 		 536 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3352  outer membrane efflux protein  39.13 
 
 		 512 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0496  putative copper resistance-related lipoprotein  35.84 
 
 		 477 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.620872 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9851  copper tolerance protein  39.09 
 
 		 486 aa  275  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1265  outer membrane efflux protein  37.55 
 
 		 481 aa  273  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5028  hypothetical protein  38.82 
 
 		 487 aa  267  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.924524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2657  outer membrane efflux protein  36.3 
 
 		 466 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2911  copper tolerance protein  38.64 
 
 		 482 aa  250  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0935  outer membrane efflux protein  34.07 
 
 		 465 aa  238  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.365344  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1079  outer membrane efflux protein  34.07 
 
 		 465 aa  238  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3484  putative copper resistance-related lipoprotein  31.8 
 
 		 472 aa  203  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2199  putative copper resistance-related lipoprotein  30.74 
 
 		 476 aa  194  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2723  putative copper resistance-related lipoprotein  32.2 
 
 		 476 aa  194  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4553  putative copper resistance-related lipoprotein  31.03 
 
 		 472 aa  192  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.910933 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1209  copper tolerance protein  33.98 
 
 		 477 aa  187  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0296816  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2599  copper tolerance protein  33.48 
 
 		 477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0277245  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5687  putative copper resistance-related lipoprotein  30.43 
 
 		 475 aa  181  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3982  putative metal ion efflux outer membrane protein  31.81 
 
 		 470 aa  180  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2670  putative copper resistance-related lipoprotein  30.11 
 
 		 476 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0933723  normal  0.360858 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0736  putative copper resistance-related lipoprotein  29.42 
 
 		 475 aa  159  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  28.03 
 
 		 547 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1205  Outer membrane protein-like protein  30 
 
 		 438 aa  98.2  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0495  outer membrane efflux protein  28.33 
 
 		 493 aa  98.2  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1262  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  34.22 
 
 		 399 aa  91.7  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2283  outer membrane efflux protein  25.79 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  28.25 
 
 		 432 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  23.5 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  25.76 
 
 		 432 aa  50.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  22.45 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1914  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.07 
 
 		 531 aa  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000272629  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25 
 
 		 437 aa  47.4  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3560  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.92 
 
 		 493 aa  47  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6200  multidrug efflux system outer membrane subunit  27.59 
 
 		 504 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.584656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.71 
 
 		 428 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3604  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.9 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.5 
 
 		 497 aa  44.3  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  23.45 
 
 		 421 aa  44.3  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>