59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5861 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_5028  hypothetical protein  75.06 
 
 		 487 aa  674    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.924524 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9851  copper tolerance protein  74.95 
 
 		 486 aa  706    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5861  conserved hypothetical conserved membrane protein  100 
 
 		 488 aa  981    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4384  outer membrane efflux protein  44.63 
 
 		 485 aa  354  2e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4633  outer membrane efflux protein  44.42 
 
 		 485 aa  352  1e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706868  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1090  outer membrane efflux protein  43.19 
 
 		 483 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6518  putative Outer membrane efflux protein  44.95 
 
 		 475 aa  335  9e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4267  copper tolerance protein  42.13 
 
 		 488 aa  329  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4904  outer membrane efflux protein  41.63 
 
 		 488 aa  325  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.878997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0118  putative copper resistance protein  44.5 
 
 		 543 aa  323  5e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4826  outer membrane efflux protein  46.55 
 
 		 475 aa  312  7.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836634  normal  0.338795 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4601  outer membrane efflux protein  44.82 
 
 		 475 aa  310  5e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.332073  normal  0.615443 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7875  outer membrane efflux protein  42.46 
 
 		 483 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639992  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1030  outer membrane efflux protein  38.96 
 
 		 535 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3911  outer membrane efflux protein  39.96 
 
 		 470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120008  normal  0.391344 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4025  outer membrane efflux protein  39.96 
 
 		 470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000146806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  38.89 
 
 		 486 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2578  outer membrane efflux protein  39.12 
 
 		 535 aa  296  4e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0560227  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6292  outer membrane efflux protein  37.91 
 
 		 498 aa  296  5e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260908 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2295  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  37.34 
 
 		 476 aa  296  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.176348 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0314  outer membrane efflux protein  39.53 
 
 		 486 aa  290  4e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.116177  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2041  outer membrane efflux protein  38.85 
 
 		 501 aa  289  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2765  outer membrane efflux protein  39.29 
 
 		 498 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2008  copper tolerance protein  38.91 
 
 		 554 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0713  outer membrane efflux protein  38.91 
 
 		 554 aa  282  9e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0496  putative copper resistance-related lipoprotein  39.51 
 
 		 477 aa  280  5e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.620872 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0621  outer membrane efflux protein  38.7 
 
 		 554 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3413  outer membrane efflux protein  38.88 
 
 		 500 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4754  outer membrane efflux protein  38.88 
 
 		 500 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203593  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1633  putative copper resistance-related lipoprotein  38.48 
 
 		 479 aa  270  5e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158935 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1960  copper tolerance protein  38.62 
 
 		 536 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4103  outer membrane efflux protein  38.83 
 
 		 500 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733493  normal  0.726802 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2657  outer membrane efflux protein  37.92 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5189  outer membrane efflux protein  39.65 
 
 		 523 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3352  outer membrane efflux protein  39.48 
 
 		 512 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1265  outer membrane efflux protein  36.6 
 
 		 481 aa  261  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0935  outer membrane efflux protein  36.2 
 
 		 465 aa  226  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.365344  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1079  outer membrane efflux protein  36.2 
 
 		 465 aa  226  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2911  copper tolerance protein  36.65 
 
 		 482 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2199  putative copper resistance-related lipoprotein  32.45 
 
 		 476 aa  207  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3982  putative metal ion efflux outer membrane protein  33.54 
 
 		 470 aa  206  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3484  putative copper resistance-related lipoprotein  34.53 
 
 		 472 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2723  putative copper resistance-related lipoprotein  34.49 
 
 		 476 aa  204  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1209  copper tolerance protein  36.24 
 
 		 477 aa  196  7e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0296816  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2599  copper tolerance protein  36.24 
 
 		 477 aa  195  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0277245  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4553  putative copper resistance-related lipoprotein  30.99 
 
 		 472 aa  195  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.910933 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2670  putative copper resistance-related lipoprotein  33.41 
 
 		 476 aa  194  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0933723  normal  0.360858 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5687  putative copper resistance-related lipoprotein  35.1 
 
 		 475 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0736  putative copper resistance-related lipoprotein  31.71 
 
 		 475 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1262  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  31.16 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1205  Outer membrane protein-like protein  33.43 
 
 		 438 aa  123  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  28.93 
 
 		 547 aa  113  9e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0495  outer membrane efflux protein  26 
 
 		 493 aa  97.8  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2283  outer membrane efflux protein  27.53 
 
 		 453 aa  87  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  24.63 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  26.78 
 
 		 437 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  26.93 
 
 		 439 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  26.93 
 
 		 439 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  23.93 
 
 		 431 aa  43.5  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>