71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4826 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4601  outer membrane efflux protein  96.84 
 
 
475 aa  842    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.332073  normal  0.615443 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4904  outer membrane efflux protein  74.43 
 
 
488 aa  655    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.878997  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4826  outer membrane efflux protein  100 
 
 
475 aa  935    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836634  normal  0.338795 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7875  outer membrane efflux protein  61.17 
 
 
483 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639992  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4384  outer membrane efflux protein  52.37 
 
 
485 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4633  outer membrane efflux protein  51.26 
 
 
485 aa  451  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706868  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4267  copper tolerance protein  52.15 
 
 
488 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1090  outer membrane efflux protein  50 
 
 
483 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0118  putative copper resistance protein  50.58 
 
 
543 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6518  putative Outer membrane efflux protein  50.32 
 
 
475 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753245  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0314  outer membrane efflux protein  47.27 
 
 
486 aa  403  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.116177  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2578  outer membrane efflux protein  46.7 
 
 
535 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0560227  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1030  outer membrane efflux protein  45.45 
 
 
535 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  43.6 
 
 
486 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2295  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  42.73 
 
 
476 aa  362  9e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.176348 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3911  outer membrane efflux protein  43.65 
 
 
470 aa  349  5e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120008  normal  0.391344 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4025  outer membrane efflux protein  43.65 
 
 
470 aa  349  5e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000146806  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6292  outer membrane efflux protein  43.75 
 
 
498 aa  346  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.260908 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0713  outer membrane efflux protein  44.14 
 
 
554 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0621  outer membrane efflux protein  44.37 
 
 
554 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2008  copper tolerance protein  44.37 
 
 
554 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2041  outer membrane efflux protein  43.05 
 
 
501 aa  333  6e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2765  outer membrane efflux protein  41.72 
 
 
498 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1960  copper tolerance protein  44.94 
 
 
536 aa  329  6e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0496  putative copper resistance-related lipoprotein  42.98 
 
 
477 aa  329  8e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.620872 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3413  outer membrane efflux protein  42.36 
 
 
500 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4754  outer membrane efflux protein  42.36 
 
 
500 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203593  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9851  copper tolerance protein  43.17 
 
 
486 aa  321  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5861  conserved hypothetical conserved membrane protein  44.35 
 
 
488 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1633  putative copper resistance-related lipoprotein  41.43 
 
 
479 aa  320  3e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.158935 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4103  outer membrane efflux protein  42.43 
 
 
500 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733493  normal  0.726802 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5189  outer membrane efflux protein  41.94 
 
 
523 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3352  outer membrane efflux protein  41.94 
 
 
512 aa  312  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1265  outer membrane efflux protein  42.35 
 
 
481 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2657  outer membrane efflux protein  41.06 
 
 
466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763881  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5028  hypothetical protein  41.87 
 
 
487 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.924524 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0935  outer membrane efflux protein  38.36 
 
 
465 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.365344  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1079  outer membrane efflux protein  38.36 
 
 
465 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2911  copper tolerance protein  35.96 
 
 
482 aa  256  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2199  putative copper resistance-related lipoprotein  33.75 
 
 
476 aa  238  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3484  putative copper resistance-related lipoprotein  35.97 
 
 
472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2723  putative copper resistance-related lipoprotein  35.09 
 
 
476 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3982  putative metal ion efflux outer membrane protein  37 
 
 
470 aa  227  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5687  putative copper resistance-related lipoprotein  34.99 
 
 
475 aa  227  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4553  putative copper resistance-related lipoprotein  35.95 
 
 
472 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.910933 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2670  putative copper resistance-related lipoprotein  33.89 
 
 
476 aa  217  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0933723  normal  0.360858 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1209  copper tolerance protein  33.7 
 
 
477 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0296816  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2599  copper tolerance protein  33.7 
 
 
477 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0277245  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0736  putative copper resistance-related lipoprotein  35.32 
 
 
475 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1262  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  32.84 
 
 
399 aa  164  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  28.12 
 
 
547 aa  104  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1205  Outer membrane protein-like protein  32.92 
 
 
438 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0495  outer membrane efflux protein  28.05 
 
 
493 aa  93.6  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2283  outer membrane efflux protein  27.54 
 
 
453 aa  91.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  26.33 
 
 
523 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.22 
 
 
489 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  26.36 
 
 
416 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1884  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.57 
 
 
464 aa  49.3  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0017284  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3604  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.94 
 
 
483 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0017  outer membrane efflux protein  23.56 
 
 
473 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  28.94 
 
 
438 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.51 
 
 
477 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  23.73 
 
 
437 aa  45.8  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.56 
 
 
497 aa  45.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1921  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.85 
 
 
514 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330678  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  22.37 
 
 
458 aa  43.9  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0309  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.76 
 
 
531 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  25.43 
 
 
435 aa  43.9  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1768  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  23.85 
 
 
493 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1745  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  23.85 
 
 
498 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  24.2 
 
 
415 aa  43.5  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>