66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2283 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2283  outer membrane efflux protein  100 
 
 
453 aa  887    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6292  outer membrane efflux protein  28.98 
 
 
498 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.260908 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4384  outer membrane efflux protein  26.83 
 
 
485 aa  126  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2657  outer membrane efflux protein  29.9 
 
 
466 aa  124  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763881  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0496  putative copper resistance-related lipoprotein  28.94 
 
 
477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.620872 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2765  outer membrane efflux protein  29.75 
 
 
498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1079  outer membrane efflux protein  30.18 
 
 
465 aa  121  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0935  outer membrane efflux protein  30.18 
 
 
465 aa  121  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.365344  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4103  outer membrane efflux protein  30.52 
 
 
500 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733493  normal  0.726802 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2295  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  28.94 
 
 
476 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.176348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4754  outer membrane efflux protein  30.27 
 
 
500 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203593  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3413  outer membrane efflux protein  30.27 
 
 
500 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1633  putative copper resistance-related lipoprotein  28.97 
 
 
479 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.158935 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0118  putative copper resistance protein  27.18 
 
 
543 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1265  outer membrane efflux protein  28.34 
 
 
481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4633  outer membrane efflux protein  26.54 
 
 
485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706868  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3982  putative metal ion efflux outer membrane protein  30.41 
 
 
470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  27.95 
 
 
486 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  29.36 
 
 
547 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1090  outer membrane efflux protein  27.19 
 
 
483 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4025  outer membrane efflux protein  29.7 
 
 
470 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000146806  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3911  outer membrane efflux protein  29.7 
 
 
470 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120008  normal  0.391344 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2008  copper tolerance protein  29.2 
 
 
554 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0713  outer membrane efflux protein  29.26 
 
 
554 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4601  outer membrane efflux protein  30.11 
 
 
475 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.332073  normal  0.615443 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2041  outer membrane efflux protein  27.31 
 
 
501 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3484  putative copper resistance-related lipoprotein  32.6 
 
 
472 aa  107  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0621  outer membrane efflux protein  28.97 
 
 
554 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5189  outer membrane efflux protein  30.46 
 
 
523 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4826  outer membrane efflux protein  30.17 
 
 
475 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836634  normal  0.338795 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2670  putative copper resistance-related lipoprotein  29.75 
 
 
476 aa  103  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0933723  normal  0.360858 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3352  outer membrane efflux protein  30.73 
 
 
512 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4267  copper tolerance protein  26.73 
 
 
488 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1960  copper tolerance protein  29.24 
 
 
536 aa  97.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6518  putative Outer membrane efflux protein  28.27 
 
 
475 aa  97.1  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753245  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4904  outer membrane efflux protein  27.06 
 
 
488 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.878997  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7875  outer membrane efflux protein  29.31 
 
 
483 aa  94  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639992  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2911  copper tolerance protein  28.63 
 
 
482 aa  93.2  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2723  putative copper resistance-related lipoprotein  29.41 
 
 
476 aa  90.9  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0736  putative copper resistance-related lipoprotein  30.08 
 
 
475 aa  90.1  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5861  conserved hypothetical conserved membrane protein  27.97 
 
 
488 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5028  hypothetical protein  31.69 
 
 
487 aa  88.2  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.924524 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5687  putative copper resistance-related lipoprotein  30.32 
 
 
475 aa  87.4  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1209  copper tolerance protein  28.94 
 
 
477 aa  86.7  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0296816  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2199  putative copper resistance-related lipoprotein  27.95 
 
 
476 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0495  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 
493 aa  84.7  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2599  copper tolerance protein  29 
 
 
477 aa  84  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0277245  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4553  putative copper resistance-related lipoprotein  30.15 
 
 
472 aa  84  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.910933 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1030  outer membrane efflux protein  27.55 
 
 
535 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2578  outer membrane efflux protein  26.53 
 
 
535 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0560227  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0314  outer membrane efflux protein  25.84 
 
 
486 aa  79  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.116177  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9851  copper tolerance protein  28.08 
 
 
486 aa  73.2  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  26.57 
 
 
408 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1541  Outer membrane efflux protein  23.93 
 
 
486 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 
438 aa  46.6  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  25.94 
 
 
408 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  21.43 
 
 
431 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1205  Outer membrane protein-like protein  28.4 
 
 
438 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  25.68 
 
 
428 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3497  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.17 
 
 
470 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  24.54 
 
 
439 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  26.26 
 
 
425 aa  43.5  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  20.78 
 
 
437 aa  43.5  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 
432 aa  43.1  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 
416 aa  43.1  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.34 
 
 
428 aa  43.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>