124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1541 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1541  Outer membrane efflux protein  100 
 
 		 486 aa  984    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  25.35 
 
 		 523 aa  118  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  24.55 
 
 		 472 aa  100  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  25.9 
 
 		 421 aa  96.3  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  28.05 
 
 		 423 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  26.24 
 
 		 438 aa  87.8  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  28.05 
 
 		 423 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  28.05 
 
 		 423 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  28.43 
 
 		 394 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  24.08 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  24.37 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  24.52 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  24.27 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  26.5 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  25.76 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  25.26 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  24.8 
 
 		 439 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  24.8 
 
 		 439 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  23.93 
 
 		 418 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  25.71 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  24.37 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  26.26 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  26.63 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  24.81 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  27.56 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  23.56 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  23.9 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  25.07 
 
 		 458 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  24.54 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  22.4 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  25.19 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  22.11 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2339  outer membrane efflux protein  23.99 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.884796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  23.5 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  23.43 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  23.46 
 
 		 485 aa  61.6  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  23.5 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  23.04 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.16 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2373  HelC protein  22.19 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31040  putative cation efflux system protein  26.09 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000919684  unclonable  5.14474e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  21.96 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  21.88 
 
 		 438 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.36 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0017  outer membrane efflux protein  28.42 
 
 		 473 aa  55.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.12 
 
 		 437 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  24.01 
 
 		 460 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  23.29 
 
 		 443 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  23.29 
 
 		 461 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  23.29 
 
 		 461 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  23.29 
 
 		 452 aa  54.7  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  23.29 
 
 		 461 aa  54.7  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  23.29 
 
 		 461 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  26.09 
 
 		 433 aa  53.9  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.23 
 
 		 449 aa  53.9  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2191  outer membrane efflux protein  26.73 
 
 		 492 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  22.6 
 
 		 407 aa  53.9  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  24.56 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  23.01 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2551  outer membrane efflux protein  24.65 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000963739  normal  0.205494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  21.67 
 
 		 444 aa  52.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  26.75 
 
 		 433 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  25.99 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0753  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.53 
 
 		 504 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.13209  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  23.17 
 
 		 437 aa  51.2  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2843  outer membrane efflux protein  25.68 
 
 		 489 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  26.77 
 
 		 435 aa  50.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4512  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 520 aa  50.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4684  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 448 aa  50.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.307779 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3607  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 448 aa  50.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.864513 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  22.33 
 
 		 423 aa  50.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  22.35 
 
 		 416 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.89 
 
 		 477 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.88 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  21.98 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  21.41 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4056  outer membrane efflux protein  25.89 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1111  Outer membrane efflux protein  24.73 
 
 		 492 aa  49.3  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.33067  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4633  outer membrane efflux protein  22.62 
 
 		 485 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706868  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  21.52 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2745  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 		 415 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  22.65 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  24.51 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  21.23 
 
 		 423 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  26.45 
 
 		 462 aa  47.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  23.92 
 
 		 479 aa  47.8  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  24.16 
 
 		 528 aa  47.4  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.82 
 
 		 553 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.31 
 
 		 428 aa  47  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4384  outer membrane efflux protein  22.62 
 
 		 485 aa  47  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0749  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25 
 
 		 504 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.11 
 
 		 522 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0715  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.82 
 
 		 504 aa  47  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.871689  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  21.69 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  23.54 
 
 		 424 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  23.59 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  21.88 
 
 		 486 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  23.11 
 
 		 432 aa  45.8  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>