More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4512 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  67.41 
 
 		 513 aa  662    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  66.8 
 
 		 514 aa  643    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4354  Outer membrane efflux protein  79.61 
 
 		 517 aa  750    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  67.21 
 
 		 514 aa  662    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4579  outer membrane efflux protein  67.48 
 
 		 515 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0188996  decreased coverage  0.000000771093 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4512  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 520 aa  1032    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  66.6 
 
 		 514 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4114  outer membrane efflux protein  67.27 
 
 		 519 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  normal  0.0282956 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  66.8 
 
 		 514 aa  643    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2121  Outer membrane efflux protein  58.03 
 
 		 509 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2191  outer membrane efflux protein  54.85 
 
 		 508 aa  503  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0193  outer membrane efflux protein  49.2 
 
 		 527 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.339929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0239  outer membrane efflux protein  47.79 
 
 		 521 aa  415  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0594  outer membrane efflux protein  38.15 
 
 		 508 aa  332  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0533  outer membrane efflux protein  39.07 
 
 		 453 aa  314  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1063  hypothetical protein  38.85 
 
 		 453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1760  hypothetical protein  59.39 
 
 		 721 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1600  outer membrane efflux protein  54.87 
 
 		 295 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0503  putative outer membrane protein  60.29 
 
 		 269 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1371  outer membrane efflux protein  60.29 
 
 		 269 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0644375  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.85 
 
 		 452 aa  110  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  27.15 
 
 		 462 aa  109  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1858  outer membrane efflux protein  31.26 
 
 		 490 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.514737  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.44 
 
 		 479 aa  99  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1943  outer membrane efflux protein  31.74 
 
 		 490 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.261377  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  23.97 
 
 		 485 aa  97.8  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.21 
 
 		 479 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.71 
 
 		 471 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.98 
 
 		 479 aa  94.7  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.98 
 
 		 471 aa  94.4  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.98 
 
 		 482 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.98 
 
 		 482 aa  94.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.98 
 
 		 482 aa  94.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  26.96 
 
 		 528 aa  93.6  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1955  outer membrane efflux protein  27.88 
 
 		 476 aa  90.9  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223795  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  25.94 
 
 		 476 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  25.94 
 
 		 476 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  25.73 
 
 		 488 aa  87.8  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.89 
 
 		 455 aa  87.4  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3497  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.99 
 
 		 470 aa  87.4  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  27.09 
 
 		 488 aa  87  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  24.49 
 
 		 495 aa  86.7  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  24.64 
 
 		 738 aa  85.9  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.11 
 
 		 546 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16116  normal  0.32958 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1789  outer membrane efflux protein  30.31 
 
 		 493 aa  83.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  25.46 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2510  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.67 
 
 		 465 aa  79.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  24.38 
 
 		 576 aa  79.7  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  24.68 
 
 		 471 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  26.34 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2020  outer membrane efflux protein  32.08 
 
 		 492 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2169  outer membrane toxin secretion efflux protein, putative  24.8 
 
 		 496 aa  78.6  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1827  outer membrane efflux protein  24.8 
 
 		 496 aa  78.6  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.115006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2819  outer membrane protein OprJ  26.34 
 
 		 468 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.980235 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0811  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.52 
 
 		 517 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173561 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0567  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.22 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.03 
 
 		 495 aa  77  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4888  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.76 
 
 		 482 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595836  normal  0.509529 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.74 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.8 
 
 		 471 aa  76.6  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.25 
 
 		 467 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.46 
 
 		 501 aa  73.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.48 
 
 		 474 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5238  outer membrane protein OprM  26.48 
 
 		 475 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  23.92 
 
 		 497 aa  71.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.76 
 
 		 470 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  24.71 
 
 		 500 aa  71.6  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2695  outer membrane efflux protein  23.97 
 
 		 512 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1582  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.33 
 
 		 515 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.16 
 
 		 500 aa  70.5  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.66 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  25 
 
 		 474 aa  70.1  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2756  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.01 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0415066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  27.32 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.52 
 
 		 514 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.54 
 
 		 514 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  27.32 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  25.51 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  22.67 
 
 		 472 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1333  outer membrane efflux protein, putative  23.16 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  24.25 
 
 		 443 aa  67  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.07 
 
 		 456 aa  66.6  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  23.62 
 
 		 436 aa  66.6  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  23.1 
 
 		 464 aa  66.6  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  23.1 
 
 		 464 aa  66.6  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.65 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.54 
 
 		 499 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  23.32 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  23.47 
 
 		 465 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.73 
 
 		 474 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  23.06 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  23.41 
 
 		 463 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  23.06 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  23.06 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  23.06 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1884  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.85 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0017284  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2259  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.46 
 
 		 508 aa  63.9  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2064  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.25 
 
 		 499 aa  63.9  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60820  outer membrane protein OprJ  25.63 
 
 		 479 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.21 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>