More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0239 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0239  outer membrane efflux protein  100 
 
 
521 aa  1042    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368646  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0193  outer membrane efflux protein  47.91 
 
 
527 aa  432  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.339929  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2121  Outer membrane efflux protein  48.44 
 
 
509 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2191  outer membrane efflux protein  48.86 
 
 
508 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4512  outer membrane efflux protein  46.73 
 
 
520 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4114  outer membrane efflux protein  45.62 
 
 
519 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  normal  0.0282956 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4579  outer membrane efflux protein  45.86 
 
 
515 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0188996  decreased coverage  0.000000771093 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  46.08 
 
 
513 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  45.09 
 
 
514 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4354  Outer membrane efflux protein  45.22 
 
 
517 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  44.69 
 
 
514 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  44.69 
 
 
514 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  44.69 
 
 
514 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0594  outer membrane efflux protein  39.09 
 
 
508 aa  328  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1063  hypothetical protein  40.26 
 
 
453 aa  317  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0533  outer membrane efflux protein  40.48 
 
 
453 aa  317  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  29.57 
 
 
488 aa  136  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.95 
 
 
452 aa  124  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1760  hypothetical protein  43.03 
 
 
721 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  28.24 
 
 
462 aa  110  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  27.03 
 
 
495 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  28.97 
 
 
528 aa  107  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  23.72 
 
 
485 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1955  outer membrane efflux protein  30.35 
 
 
476 aa  103  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223795  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1600  outer membrane efflux protein  39.66 
 
 
295 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.03 
 
 
482 aa  97.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.03 
 
 
479 aa  97.4  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.82 
 
 
479 aa  97.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.03 
 
 
482 aa  97.4  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.03 
 
 
482 aa  97.4  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.03 
 
 
471 aa  97.1  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.82 
 
 
479 aa  96.7  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  26.54 
 
 
738 aa  95.9  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1827  outer membrane efflux protein  25.67 
 
 
496 aa  94.4  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.115006  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2169  outer membrane toxin secretion efflux protein, putative  25.67 
 
 
496 aa  94.4  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  27.44 
 
 
488 aa  94.7  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.62 
 
 
471 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0503  putative outer membrane protein  41.61 
 
 
269 aa  87.4  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1371  outer membrane efflux protein  41.61 
 
 
269 aa  87.4  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0644375  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  26.13 
 
 
471 aa  87  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.89 
 
 
495 aa  84.7  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  26.14 
 
 
472 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  24.37 
 
 
476 aa  80.5  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  24.37 
 
 
476 aa  80.5  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.87 
 
 
482 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0811  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26 
 
 
517 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173561 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2510  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.72 
 
 
465 aa  75.1  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2259  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.56 
 
 
508 aa  75.1  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1858  outer membrane efflux protein  31.18 
 
 
490 aa  74.3  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.514737  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.61 
 
 
474 aa  73.6  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2178  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.49 
 
 
479 aa  72.8  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2756  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.06 
 
 
469 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0415066  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.82 
 
 
500 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.78 
 
 
501 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.3 
 
 
552 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193594 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  25.83 
 
 
489 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.67 
 
 
470 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  25.61 
 
 
489 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  22.42 
 
 
497 aa  71.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  25.61 
 
 
489 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  25.61 
 
 
489 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  22.37 
 
 
470 aa  71.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  25.61 
 
 
489 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1331  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.3 
 
 
543 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33262  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.3 
 
 
529 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0929292  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4888  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.07 
 
 
482 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595836  normal  0.509529 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2527  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.59 
 
 
507 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1943  outer membrane efflux protein  30.89 
 
 
490 aa  70.1  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.261377  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.2 
 
 
505 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0967  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.2 
 
 
525 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1449  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.2 
 
 
505 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436796  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2713  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.06 
 
 
477 aa  69.7  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.82 
 
 
525 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3836  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.17 
 
 
471 aa  69.7  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232227  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.45 
 
 
467 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41681  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2654  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.81 
 
 
507 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354944  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1370  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.59 
 
 
515 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2072  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.89 
 
 
495 aa  69.7  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0610186  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  22.2 
 
 
463 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.99 
 
 
507 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2026  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  25 
 
 
519 aa  68.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.192262 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1929  multidrug efflux outer membrane protein EefC  22.81 
 
 
457 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000583054 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6208  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.56 
 
 
497 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.842439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3497  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.75 
 
 
470 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0060  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.01 
 
 
514 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0428433  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6465  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.05 
 
 
475 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0283455 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2447  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.01 
 
 
514 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0323  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.08 
 
 
496 aa  68.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.501802  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0317  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.78 
 
 
514 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.34053  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0690  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.42 
 
 
507 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0381  outer membrane efflux protein OprB  26.01 
 
 
553 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5881  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.82 
 
 
497 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0612  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.78 
 
 
514 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2695  outer membrane efflux protein  25.54 
 
 
512 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0033  outer membrane efflux protein OprB  25.78 
 
 
512 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1046  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.78 
 
 
512 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1020  outer membrane efflux protein  25.42 
 
 
514 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.224609  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0861  outer membrane efflux protein OprB  25.42 
 
 
514 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.89354  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0856  outer membrane efflux protein OprB  25.42 
 
 
514 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>