More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1943 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1943  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 490 aa  894    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.261377  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1858  outer membrane efflux protein  97.67 
 
 		 490 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.514737  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2020  outer membrane efflux protein  93.21 
 
 		 492 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1789  outer membrane efflux protein  62.42 
 
 		 493 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  34.23 
 
 		 452 aa  190  5.999999999999999e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  37.61 
 
 		 462 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  32.27 
 
 		 738 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  31.93 
 
 		 528 aa  164  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  34.58 
 
 		 514 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4579  outer membrane efflux protein  34.45 
 
 		 515 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0188996  decreased coverage  0.000000771093 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  34.08 
 
 		 514 aa  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  34.08 
 
 		 514 aa  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  34.08 
 
 		 514 aa  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4114  outer membrane efflux protein  34.23 
 
 		 519 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  normal  0.0282956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  30.87 
 
 		 485 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  34.54 
 
 		 513 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  31.08 
 
 		 476 aa  146  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  31.08 
 
 		 476 aa  146  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4512  outer membrane efflux protein  32.22 
 
 		 520 aa  143  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  30.31 
 
 		 488 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.12 
 
 		 479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  34.61 
 
 		 472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.49 
 
 		 479 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.49 
 
 		 471 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.49 
 
 		 482 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.49 
 
 		 482 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.49 
 
 		 482 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.27 
 
 		 479 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.27 
 
 		 471 aa  140  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2121  Outer membrane efflux protein  31.19 
 
 		 509 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  34.13 
 
 		 471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2191  outer membrane efflux protein  31.64 
 
 		 508 aa  126  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  33.18 
 
 		 488 aa  123  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1955  outer membrane efflux protein  31.67 
 
 		 476 aa  123  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223795  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4354  Outer membrane efflux protein  30.32 
 
 		 517 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1827  outer membrane efflux protein  30.92 
 
 		 496 aa  118  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.115006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2169  outer membrane toxin secretion efflux protein, putative  30.92 
 
 		 496 aa  118  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0193  outer membrane efflux protein  29.83 
 
 		 527 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.339929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0594  outer membrane efflux protein  29.04 
 
 		 508 aa  114  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0239  outer membrane efflux protein  31.94 
 
 		 521 aa  113  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  28.97 
 
 		 495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1063  hypothetical protein  29.72 
 
 		 453 aa  109  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0533  outer membrane efflux protein  29.72 
 
 		 453 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  29.02 
 
 		 419 aa  94  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.5 
 
 		 499 aa  92.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  27.01 
 
 		 419 aa  90.1  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2321  putative secretion protein  36.86 
 
 		 461 aa  89.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  28.05 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  27.51 
 
 		 420 aa  86.7  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.96 
 
 		 472 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  25.6 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  26.91 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.64 
 
 		 484 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.41 
 
 		 484 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.23 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.41 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4305  outer membrane efflux protein  26.33 
 
 		 486 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.96 
 
 		 486 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.07 
 
 		 477 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.97 
 
 		 505 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  30.49 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  26.56 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  25.15 
 
 		 515 aa  77  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  30.13 
 
 		 461 aa  76.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.07 
 
 		 525 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.35 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  27.7 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  26 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.65 
 
 		 486 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  32.01 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  25.13 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  30 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  30.69 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.74 
 
 		 470 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  30.42 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.89 
 
 		 495 aa  70.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  28.15 
 
 		 485 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  26.64 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.16 
 
 		 501 aa  70.5  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  31.37 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  28.15 
 
 		 485 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2670  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.3 
 
 		 532 aa  70.1  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0133401  normal  0.268883 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.47 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  26.11 
 
 		 576 aa  70.1  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.94 
 
 		 500 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  25.99 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  29.59 
 
 		 1470 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5155  outer membrane efflux protein  31.83 
 
 		 481 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239334  normal  0.865316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0874  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.21 
 
 		 483 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1273  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.87 
 
 		 484 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0681573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  26.98 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0511  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  28.61 
 
 		 497 aa  67.4  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.79 
 
 		 483 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  29.15 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  27.72 
 
 		 499 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5005  outer membrane efflux protein  33.17 
 
 		 485 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.844775 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3447  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.73 
 
 		 477 aa  67  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.4 
 
 		 482 aa  67  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  26.53 
 
 		 498 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>