More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5155 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5155  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 481 aa  958    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239334  normal  0.865316 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5005  outer membrane efflux protein  85.84 
 
 		 485 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.844775 
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  52.36 
 
 		 488 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  49.44 
 
 		 495 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.04 
 
 		 479 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.04 
 
 		 471 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.04 
 
 		 479 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.04 
 
 		 482 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.42 
 
 		 479 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.04 
 
 		 482 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.04 
 
 		 482 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.18 
 
 		 471 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  37.17 
 
 		 462 aa  210  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.12 
 
 		 452 aa  206  8e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  32.71 
 
 		 485 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  34.92 
 
 		 488 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1955  outer membrane efflux protein  35.63 
 
 		 476 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223795  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  35.01 
 
 		 472 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  34.55 
 
 		 471 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  27.52 
 
 		 738 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4579  outer membrane efflux protein  29.85 
 
 		 515 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0188996  decreased coverage  0.000000771093 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1827  outer membrane efflux protein  29.49 
 
 		 496 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.115006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2169  outer membrane toxin secretion efflux protein, putative  29.49 
 
 		 496 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4114  outer membrane efflux protein  28.91 
 
 		 519 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  normal  0.0282956 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  29.3 
 
 		 514 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  29.3 
 
 		 514 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  29.3 
 
 		 514 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  30.29 
 
 		 528 aa  114  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  28.99 
 
 		 514 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  29.41 
 
 		 513 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0239  outer membrane efflux protein  26.41 
 
 		 521 aa  104  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1789  outer membrane efflux protein  33.08 
 
 		 493 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4512  outer membrane efflux protein  26.39 
 
 		 520 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2121  Outer membrane efflux protein  26.52 
 
 		 509 aa  98.2  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2191  outer membrane efflux protein  27.08 
 
 		 508 aa  96.7  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0594  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 508 aa  94.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1063  hypothetical protein  25 
 
 		 453 aa  94  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0533  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 453 aa  94.4  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  25.23 
 
 		 576 aa  93.2  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  25.48 
 
 		 436 aa  91.3  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0193  outer membrane efflux protein  26.7 
 
 		 527 aa  90.9  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.339929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4354  Outer membrane efflux protein  28.4 
 
 		 517 aa  87.8  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  24.29 
 
 		 435 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  25.52 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  25.52 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  26.54 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.09 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  23.03 
 
 		 434 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.73 
 
 		 1470 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  26.89 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  27.15 
 
 		 497 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.39 
 
 		 452 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.23 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  22.86 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  26.85 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3737  outer membrane efflux protein  23.21 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.315415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2321  putative secretion protein  31.04 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2896  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.42 
 
 		 477 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  22.45 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  22.19 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1943  outer membrane efflux protein  30.77 
 
 		 490 aa  77  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.261377  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  21.86 
 
 		 441 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000983275  unclonable  0.000000000104798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  22.45 
 
 		 435 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.53 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  21.15 
 
 		 448 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  22.46 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  27.09 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.41 
 
 		 491 aa  74.7  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.47 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1858  outer membrane efflux protein  30.27 
 
 		 490 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.514737  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0887  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.66 
 
 		 586 aa  73.2  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000421492  hitchhiker  0.0000263613 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.18 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1818  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.92 
 
 		 482 aa  72.8  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.332659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.5 
 
 		 499 aa  72.8  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3225  outer membrane channel protein  21.97 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000929322  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  24.11 
 
 		 515 aa  72.4  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.43 
 
 		 494 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  22.22 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.74 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3447  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.01 
 
 		 477 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  27.91 
 
 		 436 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  24.09 
 
 		 470 aa  72  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.16 
 
 		 533 aa  71.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.568762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2259  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.43 
 
 		 508 aa  71.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  25.67 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1834  multidrug efflux outer membrane protein EefC  26.09 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000044393 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  23.89 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0814  outer membrane efflux protein  30.05 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.881482  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  23.33 
 
 		 479 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  25.54 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3048  outer membrane channel protein  21.78 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000973822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  23.74 
 
 		 431 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0440  RND efflux system, outer membrane protein  26.36 
 
 		 509 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0141  RND efflux system, outer membrane protein  27.32 
 
 		 506 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.5 
 
 		 479 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  25.55 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1929  multidrug efflux outer membrane protein EefC  26.2 
 
 		 457 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000583054 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2510  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.34 
 
 		 465 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1312  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  27.32 
 
 		 508 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>