75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0496 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1633  putative copper resistance-related lipoprotein  73.03 
 
 		 479 aa  641    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158935 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0496  putative copper resistance-related lipoprotein  100 
 
 		 477 aa  951    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.620872 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1265  outer membrane efflux protein  63.27 
 
 		 481 aa  567  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2657  outer membrane efflux protein  61.31 
 
 		 466 aa  528  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  52.36 
 
 		 486 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4025  outer membrane efflux protein  54.3 
 
 		 470 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000146806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3911  outer membrane efflux protein  54.3 
 
 		 470 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120008  normal  0.391344 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2295  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  52.36 
 
 		 476 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.176348 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6292  outer membrane efflux protein  51.14 
 
 		 498 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260908 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2765  outer membrane efflux protein  51.43 
 
 		 498 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3413  outer membrane efflux protein  53.88 
 
 		 500 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4103  outer membrane efflux protein  54.02 
 
 		 500 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733493  normal  0.726802 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2041  outer membrane efflux protein  50.22 
 
 		 501 aa  458  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4754  outer membrane efflux protein  53.88 
 
 		 500 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203593  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3352  outer membrane efflux protein  53.99 
 
 		 512 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5189  outer membrane efflux protein  53.76 
 
 		 523 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2008  copper tolerance protein  51.28 
 
 		 554 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0621  outer membrane efflux protein  51.28 
 
 		 554 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0713  outer membrane efflux protein  51.28 
 
 		 554 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1960  copper tolerance protein  51.23 
 
 		 536 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1079  outer membrane efflux protein  49.1 
 
 		 465 aa  365  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0935  outer membrane efflux protein  49.1 
 
 		 465 aa  365  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.365344  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3982  putative metal ion efflux outer membrane protein  45.11 
 
 		 470 aa  346  4e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4384  outer membrane efflux protein  41.81 
 
 		 485 aa  342  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6518  putative Outer membrane efflux protein  43.18 
 
 		 475 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3484  putative copper resistance-related lipoprotein  44.17 
 
 		 472 aa  332  7.000000000000001e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1090  outer membrane efflux protein  41.65 
 
 		 483 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5687  putative copper resistance-related lipoprotein  44.87 
 
 		 475 aa  327  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4633  outer membrane efflux protein  41.53 
 
 		 485 aa  327  3e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706868  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0118  putative copper resistance protein  43.16 
 
 		 543 aa  326  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4267  copper tolerance protein  41.67 
 
 		 488 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2199  putative copper resistance-related lipoprotein  40.34 
 
 		 476 aa  318  1e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4904  outer membrane efflux protein  40.28 
 
 		 488 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.878997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4553  putative copper resistance-related lipoprotein  42 
 
 		 472 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.910933 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2670  putative copper resistance-related lipoprotein  41.36 
 
 		 476 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0933723  normal  0.360858 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2723  putative copper resistance-related lipoprotein  40.13 
 
 		 476 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4826  outer membrane efflux protein  43.01 
 
 		 475 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836634  normal  0.338795 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4601  outer membrane efflux protein  42.14 
 
 		 475 aa  307  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.332073  normal  0.615443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1030  outer membrane efflux protein  38.65 
 
 		 535 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2578  outer membrane efflux protein  37.5 
 
 		 535 aa  289  7e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0560227  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9851  copper tolerance protein  39.53 
 
 		 486 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2911  copper tolerance protein  41.15 
 
 		 482 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0314  outer membrane efflux protein  35.86 
 
 		 486 aa  273  4.0000000000000004e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.116177  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7875  outer membrane efflux protein  37.72 
 
 		 483 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639992  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0736  putative copper resistance-related lipoprotein  44.92 
 
 		 475 aa  272  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5028  hypothetical protein  40.32 
 
 		 487 aa  266  5e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.924524 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5861  conserved hypothetical conserved membrane protein  38.83 
 
 		 488 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1209  copper tolerance protein  39.91 
 
 		 477 aa  247  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0296816  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2599  copper tolerance protein  39.91 
 
 		 477 aa  246  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0277245  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1262  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  33.48 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  28.26 
 
 		 547 aa  130  6e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1205  Outer membrane protein-like protein  35.29 
 
 		 438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2283  outer membrane efflux protein  28.91 
 
 		 453 aa  109  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0495  outer membrane efflux protein  27.64 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  23.3 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  22.92 
 
 		 437 aa  55.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.06 
 
 		 488 aa  55.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  23.6 
 
 		 423 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 423 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 423 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 394 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  26.09 
 
 		 428 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  26.22 
 
 		 416 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.19 
 
 		 428 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  23.13 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  23.02 
 
 		 479 aa  47.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  24.66 
 
 		 408 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2191  outer membrane efflux protein  25.25 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.85 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  23.44 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  25.23 
 
 		 437 aa  44.3  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  23.36 
 
 		 462 aa  43.9  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 		 496 aa  43.9  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  23.47 
 
 		 408 aa  43.9  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  23.57 
 
 		 437 aa  43.1  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>