55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4553 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3484  putative copper resistance-related lipoprotein  82.2 
 
 		 472 aa  748    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4553  putative copper resistance-related lipoprotein  100 
 
 		 472 aa  944    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.910933 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5687  putative copper resistance-related lipoprotein  72.6 
 
 		 475 aa  633  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2199  putative copper resistance-related lipoprotein  58.8 
 
 		 476 aa  554  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2670  putative copper resistance-related lipoprotein  58.58 
 
 		 476 aa  549  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0933723  normal  0.360858 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2723  putative copper resistance-related lipoprotein  57.51 
 
 		 476 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0736  putative copper resistance-related lipoprotein  54.65 
 
 		 475 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3982  putative metal ion efflux outer membrane protein  44.99 
 
 		 470 aa  352  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  41.88 
 
 		 486 aa  340  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1633  putative copper resistance-related lipoprotein  44.03 
 
 		 479 aa  336  5e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158935 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0496  putative copper resistance-related lipoprotein  41.79 
 
 		 477 aa  323  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.620872 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6292  outer membrane efflux protein  41.3 
 
 		 498 aa  312  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260908 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2295  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  40.58 
 
 		 476 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.176348 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2041  outer membrane efflux protein  41.01 
 
 		 501 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0621  outer membrane efflux protein  42.89 
 
 		 554 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0713  outer membrane efflux protein  42.69 
 
 		 554 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2008  copper tolerance protein  42.69 
 
 		 554 aa  299  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1960  copper tolerance protein  43.02 
 
 		 536 aa  296  7e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1265  outer membrane efflux protein  40.76 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3911  outer membrane efflux protein  41.09 
 
 		 470 aa  294  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120008  normal  0.391344 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4025  outer membrane efflux protein  41.09 
 
 		 470 aa  294  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000146806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4754  outer membrane efflux protein  40.64 
 
 		 500 aa  287  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203593  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3413  outer membrane efflux protein  40.64 
 
 		 500 aa  287  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2765  outer membrane efflux protein  39.01 
 
 		 498 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2657  outer membrane efflux protein  41.67 
 
 		 466 aa  279  6e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4103  outer membrane efflux protein  42.76 
 
 		 500 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733493  normal  0.726802 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3352  outer membrane efflux protein  40.52 
 
 		 512 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5189  outer membrane efflux protein  40.71 
 
 		 523 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1079  outer membrane efflux protein  38.53 
 
 		 465 aa  249  8e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0935  outer membrane efflux protein  38.53 
 
 		 465 aa  249  8e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.365344  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2911  copper tolerance protein  37.18 
 
 		 482 aa  243  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6518  putative Outer membrane efflux protein  35.9 
 
 		 475 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4384  outer membrane efflux protein  33.82 
 
 		 485 aa  229  7e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4633  outer membrane efflux protein  32.78 
 
 		 485 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706868  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4826  outer membrane efflux protein  35.19 
 
 		 475 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836634  normal  0.338795 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4601  outer membrane efflux protein  35.11 
 
 		 475 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.332073  normal  0.615443 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1209  copper tolerance protein  36.72 
 
 		 477 aa  216  9e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0296816  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4904  outer membrane efflux protein  33.63 
 
 		 488 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.878997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0118  putative copper resistance protein  33.56 
 
 		 543 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2599  copper tolerance protein  36.5 
 
 		 477 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0277245  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9851  copper tolerance protein  31.89 
 
 		 486 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1090  outer membrane efflux protein  32.89 
 
 		 483 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4267  copper tolerance protein  31.03 
 
 		 488 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2578  outer membrane efflux protein  33.74 
 
 		 535 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0560227  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1030  outer membrane efflux protein  34.03 
 
 		 535 aa  201  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5861  conserved hypothetical conserved membrane protein  30.99 
 
 		 488 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0314  outer membrane efflux protein  31.01 
 
 		 486 aa  197  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.116177  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5028  hypothetical protein  34.47 
 
 		 487 aa  180  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.924524 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7875  outer membrane efflux protein  30.62 
 
 		 483 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639992  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1262  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  33.58 
 
 		 399 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1205  Outer membrane protein-like protein  34.85 
 
 		 438 aa  116  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  27.03 
 
 		 547 aa  98.2  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0495  outer membrane efflux protein  23.52 
 
 		 493 aa  77  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2283  outer membrane efflux protein  30.15 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.77 
 
 		 488 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>