79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1079 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1079  outer membrane efflux protein  100 
 
 
465 aa  937    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0935  outer membrane efflux protein  100 
 
 
465 aa  937    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.365344  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  50 
 
 
486 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6292  outer membrane efflux protein  50.92 
 
 
498 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.260908 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2295  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  49.43 
 
 
476 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.176348 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2765  outer membrane efflux protein  50.34 
 
 
498 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2041  outer membrane efflux protein  49.44 
 
 
501 aa  405  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1633  putative copper resistance-related lipoprotein  51.13 
 
 
479 aa  404  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.158935 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4025  outer membrane efflux protein  49.2 
 
 
470 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000146806  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0496  putative copper resistance-related lipoprotein  49.1 
 
 
477 aa  398  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.620872 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3911  outer membrane efflux protein  49.2 
 
 
470 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120008  normal  0.391344 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3352  outer membrane efflux protein  51.24 
 
 
512 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4754  outer membrane efflux protein  50.34 
 
 
500 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203593  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3413  outer membrane efflux protein  50.34 
 
 
500 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4103  outer membrane efflux protein  50.93 
 
 
500 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733493  normal  0.726802 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5189  outer membrane efflux protein  50.78 
 
 
523 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0713  outer membrane efflux protein  50 
 
 
554 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2008  copper tolerance protein  50 
 
 
554 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0621  outer membrane efflux protein  50 
 
 
554 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1265  outer membrane efflux protein  47.02 
 
 
481 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2657  outer membrane efflux protein  49.19 
 
 
466 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763881  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1960  copper tolerance protein  50.12 
 
 
536 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3484  putative copper resistance-related lipoprotein  41.33 
 
 
472 aa  290  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4904  outer membrane efflux protein  38.9 
 
 
488 aa  289  8e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.878997  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2199  putative copper resistance-related lipoprotein  39.29 
 
 
476 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2723  putative copper resistance-related lipoprotein  39.21 
 
 
476 aa  280  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4384  outer membrane efflux protein  37.44 
 
 
485 aa  280  5e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6518  putative Outer membrane efflux protein  37.39 
 
 
475 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753245  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1090  outer membrane efflux protein  37.05 
 
 
483 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4633  outer membrane efflux protein  37.3 
 
 
485 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706868  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5687  putative copper resistance-related lipoprotein  40 
 
 
475 aa  273  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4826  outer membrane efflux protein  37.67 
 
 
475 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836634  normal  0.338795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2578  outer membrane efflux protein  36.73 
 
 
535 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0560227  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1030  outer membrane efflux protein  36.85 
 
 
535 aa  269  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4601  outer membrane efflux protein  38.48 
 
 
475 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.332073  normal  0.615443 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4553  putative copper resistance-related lipoprotein  38.53 
 
 
472 aa  266  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.910933 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2670  putative copper resistance-related lipoprotein  39.02 
 
 
476 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0933723  normal  0.360858 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0118  putative copper resistance protein  36.83 
 
 
543 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4267  copper tolerance protein  35.87 
 
 
488 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0314  outer membrane efflux protein  34 
 
 
486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.116177  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2911  copper tolerance protein  38.75 
 
 
482 aa  245  9e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7875  outer membrane efflux protein  35.47 
 
 
483 aa  239  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639992  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9851  copper tolerance protein  35.23 
 
 
486 aa  236  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3982  putative metal ion efflux outer membrane protein  36.11 
 
 
470 aa  233  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5861  conserved hypothetical conserved membrane protein  36.2 
 
 
488 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5028  hypothetical protein  36.26 
 
 
487 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.924524 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0736  putative copper resistance-related lipoprotein  38.68 
 
 
475 aa  212  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1209  copper tolerance protein  36.16 
 
 
477 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0296816  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2599  copper tolerance protein  35.96 
 
 
477 aa  187  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0277245  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1262  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  33.41 
 
 
399 aa  151  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  28.16 
 
 
547 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0495  outer membrane efflux protein  29.23 
 
 
493 aa  124  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2283  outer membrane efflux protein  30.18 
 
 
453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1205  Outer membrane protein-like protein  34.01 
 
 
438 aa  91.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  28.1 
 
 
432 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  27.22 
 
 
432 aa  55.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  24.35 
 
 
415 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2191  outer membrane efflux protein  23.23 
 
 
492 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  24.49 
 
 
423 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  24.49 
 
 
423 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  24.49 
 
 
423 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0017  outer membrane efflux protein  25.78 
 
 
473 aa  50.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.1 
 
 
488 aa  50.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  24.49 
 
 
394 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  24.39 
 
 
416 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.12 
 
 
494 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 
431 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  25.12 
 
 
458 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  25.94 
 
 
448 aa  47.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  23.04 
 
 
440 aa  46.6  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  23.95 
 
 
428 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
437 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 
443 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  23.62 
 
 
439 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  24.13 
 
 
435 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  23.62 
 
 
439 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 
437 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  28.33 
 
 
434 aa  43.9  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  21.96 
 
 
437 aa  43.1  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>