61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0118 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0118  putative copper resistance protein  100 
 
 		 543 aa  1098    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1090  outer membrane efflux protein  72.12 
 
 		 483 aa  673    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4267  copper tolerance protein  72.77 
 
 		 488 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4384  outer membrane efflux protein  72.25 
 
 		 485 aa  677    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4633  outer membrane efflux protein  71.19 
 
 		 485 aa  690    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706868  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6518  putative Outer membrane efflux protein  64.16 
 
 		 475 aa  585  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4904  outer membrane efflux protein  48.74 
 
 		 488 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.878997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4601  outer membrane efflux protein  50.92 
 
 		 475 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.332073  normal  0.615443 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4826  outer membrane efflux protein  50.69 
 
 		 475 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836634  normal  0.338795 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0314  outer membrane efflux protein  44.68 
 
 		 486 aa  365  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.116177  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7875  outer membrane efflux protein  43.22 
 
 		 483 aa  360  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639992  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2578  outer membrane efflux protein  44.84 
 
 		 535 aa  355  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0560227  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1030  outer membrane efflux protein  45.05 
 
 		 535 aa  353  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  41.94 
 
 		 486 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0496  putative copper resistance-related lipoprotein  42.45 
 
 		 477 aa  331  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.620872 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5861  conserved hypothetical conserved membrane protein  42.65 
 
 		 488 aa  329  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6292  outer membrane efflux protein  41.74 
 
 		 498 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260908 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2295  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  40.74 
 
 		 476 aa  327  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.176348 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2041  outer membrane efflux protein  41.61 
 
 		 501 aa  326  6e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2008  copper tolerance protein  42.49 
 
 		 554 aa  325  9e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0713  outer membrane efflux protein  42.49 
 
 		 554 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1633  putative copper resistance-related lipoprotein  42.73 
 
 		 479 aa  325  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158935 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0621  outer membrane efflux protein  42.26 
 
 		 554 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9851  copper tolerance protein  43.99 
 
 		 486 aa  324  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2765  outer membrane efflux protein  40.65 
 
 		 498 aa  323  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4754  outer membrane efflux protein  41.06 
 
 		 500 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203593  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1960  copper tolerance protein  42.57 
 
 		 536 aa  318  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3413  outer membrane efflux protein  41.06 
 
 		 500 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4103  outer membrane efflux protein  40.74 
 
 		 500 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733493  normal  0.726802 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5189  outer membrane efflux protein  41.74 
 
 		 523 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3352  outer membrane efflux protein  41.19 
 
 		 512 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4025  outer membrane efflux protein  39.77 
 
 		 470 aa  306  7e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000146806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3911  outer membrane efflux protein  39.77 
 
 		 470 aa  306  7e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120008  normal  0.391344 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5028  hypothetical protein  42.12 
 
 		 487 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.924524 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1265  outer membrane efflux protein  39.86 
 
 		 481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2657  outer membrane efflux protein  37.01 
 
 		 466 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1079  outer membrane efflux protein  36.97 
 
 		 465 aa  254  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0935  outer membrane efflux protein  36.97 
 
 		 465 aa  254  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.365344  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2911  copper tolerance protein  35.59 
 
 		 482 aa  227  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3484  putative copper resistance-related lipoprotein  34.82 
 
 		 472 aa  226  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3982  putative metal ion efflux outer membrane protein  35.29 
 
 		 470 aa  219  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2199  putative copper resistance-related lipoprotein  33.78 
 
 		 476 aa  217  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2723  putative copper resistance-related lipoprotein  33.26 
 
 		 476 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4553  putative copper resistance-related lipoprotein  33.48 
 
 		 472 aa  214  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.910933 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2670  putative copper resistance-related lipoprotein  33.86 
 
 		 476 aa  213  7.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0933723  normal  0.360858 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5687  putative copper resistance-related lipoprotein  34.71 
 
 		 475 aa  206  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2599  copper tolerance protein  32.21 
 
 		 477 aa  184  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0277245  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1209  copper tolerance protein  32.14 
 
 		 477 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0296816  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0736  putative copper resistance-related lipoprotein  33.96 
 
 		 475 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1262  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  30.95 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2283  outer membrane efflux protein  27.25 
 
 		 453 aa  103  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  25.55 
 
 		 547 aa  99.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0495  outer membrane efflux protein  26.87 
 
 		 493 aa  91.7  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1205  Outer membrane protein-like protein  29.7 
 
 		 438 aa  88.6  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  23.71 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  33.33 
 
 		 503 aa  47.4  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  21.52 
 
 		 523 aa  44.7  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  25.21 
 
 		 435 aa  44.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  21.83 
 
 		 451 aa  44.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01780  outer membrane CHANEL lipoprotein  25.81 
 
 		 522 aa  44.3  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  25.11 
 
 		 435 aa  43.5  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>