191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1043 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1043  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 516 aa  1055    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.34335  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11261  ABC transporter substrate-binding protein  78.19 
 
 		 506 aa  806    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.319641  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11341  ABC transporter substrate-binding protein  96.9 
 
 		 513 aa  980    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472786  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1035  ABC-type metal ion transport system periplasmic component  61.46 
 
 		 515 aa  579  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19051  ABC transporter substrate-binding protein  61.9 
 
 		 509 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15221  hypothetical protein  67.64 
 
 		 371 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.508004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11341  ABC transporter substrate-binding protein  70.26 
 
 		 387 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29281  ABC transporter substrate-binding protein  34.78 
 
 		 326 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1604  ABC transporter substrate-binding protein  31 
 
 		 308 aa  121  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0613847 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1364  ABC transporter substrate-binding protein  27.78 
 
 		 305 aa  110  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  36.51 
 
 		 326 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  36.9 
 
 		 317 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  32.22 
 
 		 335 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  32.78 
 
 		 335 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  34.81 
 
 		 319 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  23.53 
 
 		 345 aa  90.9  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  27.37 
 
 		 354 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0288  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 		 326 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.937251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  30.94 
 
 		 371 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89316  ZIP family transporter: zinc ion  33.33 
 
 		 472 aa  87  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.68931  normal  0.0947309 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  27.09 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  29.67 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0053  periplasmic solute binding protein  31 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0166309  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  30.77 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  28.28 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25431  ZIP family transporter: zinc ion  32.62 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.155858 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29694  ZIP family transporter: zinc ion  32.62 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0036517 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  24.39 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  25.39 
 
 		 346 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1258  periplasmic solute binding protein  30.07 
 
 		 494 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00438687  decreased coverage  0.000164305 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  29.17 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1591  periplasmic solute binding protein  27.15 
 
 		 497 aa  74.7  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  27.03 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  27.32 
 
 		 312 aa  72.8  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  26.55 
 
 		 311 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  24.88 
 
 		 346 aa  72  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  27.86 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  25.79 
 
 		 306 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07770  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.5 
 
 		 331 aa  69.3  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0098  twin-arginine translocation pathway signal  27.13 
 
 		 320 aa  69.3  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  26.09 
 
 		 309 aa  69.3  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2080  periplasmic solute binding protein  26.43 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  25.31 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  25.88 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  24.2 
 
 		 333 aa  67  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  22.82 
 
 		 307 aa  67  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2805  periplasmic solute binding protein  24.06 
 
 		 326 aa  66.6  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  19.66 
 
 		 327 aa  66.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  25.19 
 
 		 298 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  25.93 
 
 		 303 aa  65.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  21.64 
 
 		 321 aa  65.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  23.5 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  25.88 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.28 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  24.29 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  26.37 
 
 		 311 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  26.37 
 
 		 311 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  25.9 
 
 		 320 aa  63.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  24.21 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  25.87 
 
 		 311 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  24.53 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  24.87 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  22.91 
 
 		 301 aa  62  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  26.71 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  28.47 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  23.15 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  27.46 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  22.6 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  28 
 
 		 304 aa  59.7  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2620  periplasmic solute binding protein  26.99 
 
 		 532 aa  60.1  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  25.41 
 
 		 323 aa  59.7  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  23.56 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 303 aa  59.3  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4809  periplasmic solute binding protein  24.07 
 
 		 212 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5108  periplasmic solute binding protein  24.07 
 
 		 212 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829709  normal  0.108422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4723  periplasmic solute binding protein  24.07 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.796516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  23.77 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  27.97 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  23.03 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  23.12 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  24.2 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  26.34 
 
 		 311 aa  57  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1238  anchored repeat ABC transporter, substrate-binding protein  29.63 
 
 		 571 aa  57  0.0000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000243739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2380  periplasmic solute binding protein  26 
 
 		 514 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  24.42 
 
 		 303 aa  56.2  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  21.08 
 
 		 302 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  24.86 
 
 		 299 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17080  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.03 
 
 		 347 aa  55.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222095  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  24.84 
 
 		 294 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  25.73 
 
 		 313 aa  56.2  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  27.12 
 
 		 310 aa  55.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  25.97 
 
 		 320 aa  55.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  21.92 
 
 		 335 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  22.45 
 
 		 304 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  22.63 
 
 		 309 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2033  periplasmic solute binding protein  26.67 
 
 		 532 aa  54.7  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.395219 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  22.46 
 
 		 292 aa  54.7  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  26.95 
 
 		 285 aa  54.3  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  29.1 
 
 		 311 aa  53.9  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  24.82 
 
 		 292 aa  53.5  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>