266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_19051 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_11341  ABC transporter substrate-binding protein  64.93 
 
 		 513 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472786  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1035  ABC-type metal ion transport system periplasmic component  98.04 
 
 		 515 aa  918    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11261  ABC transporter substrate-binding protein  65.39 
 
 		 506 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.319641  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19051  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 509 aa  1046    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1043  ABC transporter substrate-binding protein  63.24 
 
 		 516 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.34335  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15221  hypothetical protein  82.97 
 
 		 371 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.508004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11341  ABC transporter substrate-binding protein  64.1 
 
 		 387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29281  ABC transporter substrate-binding protein  35.96 
 
 		 326 aa  154  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1364  ABC transporter substrate-binding protein  27.59 
 
 		 305 aa  123  9e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1604  ABC transporter substrate-binding protein  30.1 
 
 		 308 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0613847 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  26.83 
 
 		 345 aa  107  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  29.53 
 
 		 346 aa  105  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  31.84 
 
 		 326 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  32.5 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  28.89 
 
 		 354 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  33.52 
 
 		 371 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  31.28 
 
 		 335 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  30.73 
 
 		 335 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  30.39 
 
 		 313 aa  94.7  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89316  ZIP family transporter: zinc ion  36.3 
 
 		 472 aa  92.8  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.68931  normal  0.0947309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0288  periplasmic solute binding protein  30.05 
 
 		 326 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.937251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  24.72 
 
 		 327 aa  91.3  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  31.32 
 
 		 325 aa  90.5  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  28.23 
 
 		 356 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1258  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 494 aa  87.4  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00438687  decreased coverage  0.000164305 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  28.57 
 
 		 344 aa  87  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  31.09 
 
 		 328 aa  86.7  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  30.22 
 
 		 309 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1591  periplasmic solute binding protein  27.51 
 
 		 497 aa  83.2  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  28.49 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0053  periplasmic solute binding protein  29.53 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0166309  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  27.6 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25431  ZIP family transporter: zinc ion  35 
 
 		 477 aa  80.5  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.155858 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29694  ZIP family transporter: zinc ion  35 
 
 		 477 aa  80.5  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0036517 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  25.37 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  22.44 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  25.38 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  26.09 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  21.91 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  25.4 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.21 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  22.84 
 
 		 321 aa  72.8  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  27.56 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  24.27 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  25.99 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  27 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  25.4 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  26.79 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  26.92 
 
 		 298 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  26.77 
 
 		 309 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  24.1 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  22.6 
 
 		 292 aa  67  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  24.29 
 
 		 292 aa  67  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  26.92 
 
 		 298 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  22.17 
 
 		 300 aa  66.6  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  22.22 
 
 		 309 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  23.74 
 
 		 315 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  23.73 
 
 		 292 aa  66.6  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  23.86 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  26.97 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  22.33 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  24.87 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  24.46 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  24.34 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  23.38 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  22.03 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  25.9 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  23.9 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  21.47 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  25 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  25 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  23.94 
 
 		 315 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.7 
 
 		 315 aa  62.8  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2805  periplasmic solute binding protein  24.86 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  22.35 
 
 		 301 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1312  periplasmic solute binding protein  24.68 
 
 		 306 aa  62  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  22.01 
 
 		 303 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  21.64 
 
 		 309 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  23.16 
 
 		 292 aa  62  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  24.5 
 
 		 311 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  26.32 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  23.68 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  26.24 
 
 		 320 aa  62  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  22.56 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  22.16 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1827  high-affinity zinc transporter periplasmic component  34.48 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0735941  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07770  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  23.08 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2111  high-affinity zinc transporter periplasmic component  34.69 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0209857  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  23.53 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1111  periplasmic solute binding protein  25.93 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  24.86 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  25.83 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  23.33 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0845  periplasmic solute binding family protein  25.52 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  22.6 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  22.49 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  23.87 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2856  periplasmic solute binding protein  21.6 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>