More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1364 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1364  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 305 aa  613  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1604  ABC transporter substrate-binding protein  55.08 
 
 		 308 aa  352  2.9999999999999997e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0613847 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29281  ABC transporter substrate-binding protein  51.71 
 
 		 326 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  27.45 
 
 		 345 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  29.82 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  27.37 
 
 		 356 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15221  hypothetical protein  29.69 
 
 		 371 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.508004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19051  ABC transporter substrate-binding protein  28.12 
 
 		 509 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1035  ABC-type metal ion transport system periplasmic component  28.12 
 
 		 515 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  29.6 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  29.89 
 
 		 326 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0288  periplasmic solute binding protein  27.56 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.937251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11261  ABC transporter substrate-binding protein  29.8 
 
 		 506 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.319641  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  28.73 
 
 		 325 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  27.08 
 
 		 335 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11341  ABC transporter substrate-binding protein  29.02 
 
 		 513 aa  115  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472786  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  27.08 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11341  ABC transporter substrate-binding protein  29.17 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  27.6 
 
 		 371 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1043  ABC transporter substrate-binding protein  27.98 
 
 		 516 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.34335  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  26.3 
 
 		 354 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  28.29 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  29.62 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  25.74 
 
 		 344 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  26.44 
 
 		 353 aa  99  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  24.8 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 309 aa  96.3  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0053  periplasmic solute binding protein  26.39 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0166309  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 346 aa  92.8  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  25.08 
 
 		 303 aa  89.4  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  24.44 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  24.32 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  24.83 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1071  periplasmic solute binding protein  26.89 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  25.5 
 
 		 303 aa  86.7  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  26.64 
 
 		 341 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  26.37 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  29 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3168  periplasmic solute binding protein  25.77 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6284  periplasmic solute binding protein  24.4 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  26.64 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  25.71 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  25.27 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2856  periplasmic solute binding protein  26.15 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  25.74 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  27.43 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  22.97 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10491  ABC transporter substrate-binding protein  24.83 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03390  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.3 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0098  twin-arginine translocation pathway signal  29.17 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  28.25 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  28.39 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  24.51 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2080  periplasmic solute binding protein  29.19 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1312  periplasmic solute binding protein  25.29 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  26.59 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  25.87 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  27.69 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0290  ABC transporter, substrate-binding protein  25.13 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  25.34 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  25.34 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  25.34 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  24.79 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  24.81 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  24.25 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  27.53 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  22.83 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1663  putative ABC transporter substrate-binding protein  25 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.315809  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  25.27 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  26.91 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  26.82 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  25.5 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  29.61 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  26.97 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  22.87 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  22.73 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  29.19 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  22.87 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  26.91 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0722  AfeA  24.79 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.738909  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  23.31 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  25.23 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  24.35 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  26.45 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  23.85 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  24.48 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  30.57 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  25.82 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2141  periplasmic solute binding protein  24.59 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  20.79 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  22.38 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  22.38 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  23.22 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  25.52 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  24.82 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  29.44 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0678  periplasmic solute binding protein  23.41 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0630556 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0845  periplasmic solute binding family protein  22.34 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  24.71 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>