More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1604 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1604  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 308 aa  630  1e-180  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0613847 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1364  ABC transporter substrate-binding protein  55.08 
 
 		 305 aa  352  2.9999999999999997e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29281  ABC transporter substrate-binding protein  48.9 
 
 		 326 aa  305  6e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11341  ABC transporter substrate-binding protein  33.33 
 
 		 387 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19051  ABC transporter substrate-binding protein  30.21 
 
 		 509 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1035  ABC-type metal ion transport system periplasmic component  30.21 
 
 		 515 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0288  periplasmic solute binding protein  27.39 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.937251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  24.93 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1043  ABC transporter substrate-binding protein  32.81 
 
 		 516 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.34335  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11261  ABC transporter substrate-binding protein  30.81 
 
 		 506 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.319641  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11341  ABC transporter substrate-binding protein  32.81 
 
 		 513 aa  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472786  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  26.13 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  25.78 
 
 		 335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  25.43 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15221  hypothetical protein  30.21 
 
 		 371 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.508004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  27.43 
 
 		 356 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  25.16 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  25.57 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 371 aa  105  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  28.23 
 
 		 319 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  24.37 
 
 		 325 aa  99.4  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  27.06 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  25.09 
 
 		 313 aa  96.3  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  22.99 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0053  periplasmic solute binding protein  27.12 
 
 		 313 aa  92.8  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0166309  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  27.96 
 
 		 309 aa  92.8  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  27.5 
 
 		 302 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 293 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2856  periplasmic solute binding protein  28.17 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6284  periplasmic solute binding protein  27.03 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  26.55 
 
 		 303 aa  87  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  26.07 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  25.69 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1071  periplasmic solute binding protein  24.83 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  22.77 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  22.79 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  24.75 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  25.21 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2080  periplasmic solute binding protein  28.5 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  22.7 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  24.39 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  28.4 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  25.53 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  26.39 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  25.56 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  26.39 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  22.31 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  23.38 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0701  periplasmic solute binding protein  24.88 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  21 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  25.98 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  23.73 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  21.78 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  21.78 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  23.73 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  23.05 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  25.87 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  25.6 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  27.43 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0824  periplasmic solute binding protein  26.56 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  23.4 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0801  periplasmic solute binding protein  26.56 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  23.53 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  20.33 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  25.59 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  24.69 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03390  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  24.62 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  22.97 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  23.75 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  24.82 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  26.16 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2025  Mn/Zn ABC transporter, substrate-binding protein  27.23 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0722  AfeA  23.41 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.738909  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  24.4 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0338  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.25 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.166194  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  23.98 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  24.1 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  23.43 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  24.81 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  24.68 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0098  twin-arginine translocation pathway signal  24.23 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  22.65 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  26.43 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  22.53 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  25.54 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.33 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  23.26 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  24.79 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  24.7 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2895  twin-arginine translocation pathway signal  24.57 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1612  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  24.02 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0432091  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  19.94 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  24.26 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  23.76 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3927  periplasmic solute binding protein  26.32 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.51869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  24.89 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  24.28 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  24.9 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0290  ABC transporter, substrate-binding protein  23.2 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>