More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2853 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 321 aa  651    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0098  twin-arginine translocation pathway signal  64.29 
 
 		 320 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2080  periplasmic solute binding protein  65.74 
 
 		 316 aa  386  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  48.23 
 
 		 315 aa  285  5e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  46.64 
 
 		 309 aa  285  5e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  43.75 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  44.01 
 
 		 312 aa  282  6.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  43.84 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  45.91 
 
 		 305 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  44.98 
 
 		 321 aa  257  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  43.64 
 
 		 300 aa  252  5.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2025  Mn/Zn ABC transporter, substrate-binding protein  43.32 
 
 		 305 aa  248  7e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  44.6 
 
 		 306 aa  248  9e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  46.24 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  40.14 
 
 		 311 aa  243  3e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  42.05 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  38.59 
 
 		 313 aa  228  8e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  41.07 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  42.64 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5758  periplasmic solute binding protein  40.46 
 
 		 319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03390  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  38.16 
 
 		 319 aa  212  7e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1995  periplasmic solute binding protein  38.73 
 
 		 370 aa  207  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  37.59 
 
 		 306 aa  202  6e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  37.5 
 
 		 294 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  35.05 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  35.97 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  35.88 
 
 		 302 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  35.11 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  32.56 
 
 		 344 aa  166  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 		 326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  34.52 
 
 		 298 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  32.9 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  33.81 
 
 		 298 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  34.56 
 
 		 321 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  32.23 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  32.34 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  35.43 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  31.48 
 
 		 311 aa  159  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  32.28 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0701  periplasmic solute binding protein  30.48 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  29.1 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  30.36 
 
 		 292 aa  155  7e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  35.31 
 
 		 304 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  31.91 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  35.23 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  31.91 
 
 		 311 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  32.53 
 
 		 301 aa  153  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  31.91 
 
 		 311 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  34.39 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  32.55 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  34.08 
 
 		 303 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  28.72 
 
 		 292 aa  149  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  32.14 
 
 		 301 aa  148  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  34.28 
 
 		 320 aa  149  9e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  32.21 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  30.79 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  28.43 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  30.45 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  33.88 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  34.49 
 
 		 346 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  32.58 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  30.45 
 
 		 335 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  30.12 
 
 		 333 aa  145  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  32.91 
 
 		 346 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  33.55 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  29.63 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  29.83 
 
 		 298 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  29.63 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  29.63 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  29.04 
 
 		 303 aa  144  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0678  periplasmic solute binding protein  35.06 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0630556 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  30.85 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  31.29 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0623  periplasmic solute binding protein  34.09 
 
 		 299 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917925 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  32.4 
 
 		 292 aa  142  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  26.71 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  26.71 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  30.52 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  31.77 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  31.18 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  30.14 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10491  ABC transporter substrate-binding protein  30.28 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  30.6 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  29.96 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  32.03 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  31.38 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  32.12 
 
 		 307 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  31.19 
 
 		 316 aa  139  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  29.68 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  28.12 
 
 		 313 aa  138  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  29.79 
 
 		 356 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  29.62 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1311  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron chelate-binding protein  29.9 
 
 		 302 aa  135  8e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  31.21 
 
 		 303 aa  135  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.5 
 
 		 315 aa  135  9e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2141  periplasmic solute binding protein  31.51 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.53 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>