More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1532 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 346 aa  681    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  39.66 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  38.81 
 
 		 309 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  37.59 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  38.54 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  36.99 
 
 		 325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  35.24 
 
 		 293 aa  183  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  36.52 
 
 		 298 aa  179  9e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  39.93 
 
 		 321 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  32.88 
 
 		 353 aa  172  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  37.54 
 
 		 304 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  32.82 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  35.58 
 
 		 307 aa  172  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  33.91 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  35.49 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  35.42 
 
 		 333 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  35.28 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  35.29 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  35.29 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  31.76 
 
 		 356 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  36.68 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  35.14 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  35.03 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  32.2 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  32.65 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  33.79 
 
 		 301 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 301 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  32.05 
 
 		 317 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  33.56 
 
 		 301 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  32.42 
 
 		 292 aa  162  9e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  34.9 
 
 		 313 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  33.13 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0623  periplasmic solute binding protein  34.98 
 
 		 299 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0678  periplasmic solute binding protein  34.98 
 
 		 299 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0630556 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  34.07 
 
 		 302 aa  159  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  31.29 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  29.88 
 
 		 371 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  28.91 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  32.53 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  35.28 
 
 		 320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  35.84 
 
 		 309 aa  156  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  34.14 
 
 		 292 aa  155  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  35.29 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1258  periplasmic solute binding protein  42.47 
 
 		 494 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00438687  decreased coverage  0.000164305 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  29.55 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1312  periplasmic solute binding protein  35.19 
 
 		 306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  31.03 
 
 		 336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2836  periplasmic solute binding protein  36.86 
 
 		 299 aa  153  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  30.28 
 
 		 344 aa  153  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  34.25 
 
 		 307 aa  152  7e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  31.29 
 
 		 291 aa  152  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0845  periplasmic solute binding protein  35.76 
 
 		 289 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1591  periplasmic solute binding protein  43.01 
 
 		 497 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  34.68 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  30.03 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  29.54 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  34.11 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07770  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  36.27 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  31.1 
 
 		 319 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  34.15 
 
 		 339 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  33.68 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  32.76 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  29.36 
 
 		 335 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  29.07 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2856  periplasmic solute binding protein  34.47 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.83 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  33.33 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  32.62 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  32.22 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  26.22 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  32.91 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  35.14 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  35.4 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  31.76 
 
 		 309 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  27.63 
 
 		 318 aa  142  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  27.19 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5758  periplasmic solute binding protein  35.59 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0053  periplasmic solute binding protein  29.53 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0166309  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  33.01 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  29.39 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  28.97 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6284  periplasmic solute binding protein  32.72 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  26.38 
 
 		 311 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  31.33 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  30.25 
 
 		 305 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  26.59 
 
 		 311 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  26.59 
 
 		 311 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  32.33 
 
 		 321 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  25.6 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  29.1 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.76 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  36.59 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.04 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  30.63 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  29.55 
 
 		 347 aa  129  6e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  30.1 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  31.02 
 
 		 315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  32.12 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  28.48 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  29.39 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>