More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1601 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 325 aa  664    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  73.1 
 
 		 344 aa  478  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  65.12 
 
 		 371 aa  428  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  72.14 
 
 		 319 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  63.55 
 
 		 317 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  62.58 
 
 		 326 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  49.84 
 
 		 313 aa  306  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  44.28 
 
 		 356 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  40.63 
 
 		 354 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  42.73 
 
 		 335 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  42.42 
 
 		 335 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  40.62 
 
 		 345 aa  250  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0288  periplasmic solute binding protein  38.94 
 
 		 326 aa  222  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.937251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  42.4 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  42.4 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  32.14 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  33.23 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  37 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  36.07 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  34.68 
 
 		 292 aa  189  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  33.33 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  33.33 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  32.68 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  33.82 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  33.7 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  37.05 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  34.91 
 
 		 298 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  34.11 
 
 		 315 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  36.14 
 
 		 309 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  36.92 
 
 		 291 aa  175  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  34.27 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  31.61 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  35.44 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  35.11 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  35.48 
 
 		 309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  33.11 
 
 		 314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  34.18 
 
 		 298 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  34.21 
 
 		 306 aa  173  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  33.94 
 
 		 301 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  35.61 
 
 		 315 aa  172  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  32.96 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  34.63 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  34.56 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  31.14 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  33.68 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  34.39 
 
 		 328 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  33.75 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  32.8 
 
 		 307 aa  168  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  31.94 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  32.37 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  35.48 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  35.49 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  33.92 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  32.46 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  32.63 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  34.64 
 
 		 320 aa  166  5e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  32.38 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  34.03 
 
 		 304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3014  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  33.11 
 
 		 305 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0700149 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3066  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  33.11 
 
 		 305 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  0.0719754 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3171  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  33.11 
 
 		 305 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.866924 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  34.16 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  32.4 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3050  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  32.78 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0195762 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2805  periplasmic solute binding protein  32.91 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2983  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  32.78 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  31.85 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  34.51 
 
 		 320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  33.45 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  33.45 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.18 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  34.52 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1111  periplasmic solute binding protein  32.12 
 
 		 303 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  31.17 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  31.44 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 292 aa  159  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1995  periplasmic solute binding protein  31.68 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  31.67 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  30.65 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0678  periplasmic solute binding protein  32.98 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0630556 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0623  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 299 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917925 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  32.55 
 
 		 304 aa  155  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  32.49 
 
 		 303 aa  155  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  31.91 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  34.31 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  31.97 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  31.92 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1612  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  32.53 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0432091  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0297  periplasmic solute binding protein  29.71 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0234277  normal  0.0497295 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  32.99 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  29.55 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  29.28 
 
 		 302 aa  153  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0098  twin-arginine translocation pathway signal  31.1 
 
 		 320 aa  153  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  32.77 
 
 		 311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  32.98 
 
 		 324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  34.05 
 
 		 339 aa  152  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  32.75 
 
 		 347 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  30.97 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  28.38 
 
 		 292 aa  149  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>